Back to search

Romulo Acácio DOS SANTOS

Bachelor's thesis

Comparison of bioinformatics pipelines for eDNA metabarcoding data analysis of fish populations in Czech reservoirs

DNA metabarcoding data anlyses of fish populations in Czech standing waters, a pilot environmental DNA study
Abstract:
The aim of the study is a comparison of five distinct pipelines for environmental DNA (eDNA) metabarcoding using data collected in three reservoirs (Klíčava, Římov, and Žlutice) in the summer and autumn seasons. The results are analysed by comparing the number of reads assigned, number of species detected, and ecological indices (alpha and beta diversity). Finally, statistical analysis is applied to …more
Abstract:
The aim of the study is a comparison of five distinct pipelines for environmental DNA (eDNA) metabarcoding using data collected in three reservoirs (Klíčava, Římov, and Žlutice) in the summer and autumn seasons. The results are analysed by comparing the number of reads assigned, number of species detected, and ecological indices (alpha and beta diversity). Finally, statistical analysis is applied to …more
 
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 4. 2021

Thesis defence

  • Supervisor: RNDr. Petr Blabolil, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

DOS SANTOS, Romulo Acácio. Comparison of bioinformatics pipelines for eDNA metabarcoding data analysis of fish populations in Czech reservoirs. Č. Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=56965 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
  • No theses on a related topic available.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses 9003oy 9003oy/2
14/4/2021
Folders
Files
thesis dos_Santos_Romulo_2021_BT.pdf
Bulánová, L.
15/4/2021

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.