Zpět na vyhledávání

Romulo Acácio DOS SANTOS

Bachelor's thesis

Comparison of bioinformatics pipelines for eDNA metabarcoding data analysis of fish populations in Czech reservoirs

DNA metabarcoding data anlyses of fish populations in Czech standing waters, a pilot environmental DNA study
Abstract:
The aim of the study is a comparison of five distinct pipelines for environmental DNA (eDNA) metabarcoding using data collected in three reservoirs (Klíčava, Římov, and Žlutice) in the summer and autumn seasons. The results are analysed by comparing the number of reads assigned, number of species detected, and ecological indices (alpha and beta diversity). Finally, statistical analysis is applied to …viac
Abstract:
The aim of the study is a comparison of five distinct pipelines for environmental DNA (eDNA) metabarcoding using data collected in three reservoirs (Klíčava, Římov, and Žlutice) in the summer and autumn seasons. The results are analysed by comparing the number of reads assigned, number of species detected, and ecological indices (alpha and beta diversity). Finally, statistical analysis is applied to …viac
 
 
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedúci: RNDr. Petr Blabolil, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

DOS SANTOS, Romulo Acácio. Comparison of bioinformatics pipelines for eDNA metabarcoding data analysis of fish populations in Czech reservoirs. Č. Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=56965 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Bioinformatics

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
  • Žádné práce na příbuzné téma.
 
Názov
Vložil
Vložené
Práva
Theses 9003oy 9003oy/2
14. 4. 2021
Složky
Soubory
thesis dos_Santos_Romulo_2021_BT.pdf
Bulánová, L.
15. 4. 2021

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.