Mikrosatelitová identifikace vybraných kultivarů brusnice chocholičnaté (Vaccinium corymbosum)

Bc. Monika BALAŽÍKOVÁ

Master's thesis

Microsatellite identification of selected cultivars of highbush blueberry (Vaccinium corymbosum).

Abstract:

V mé diplomové práci jsem se věnovala mikrosatelitním markerům, které slouží pro identifikaci kultivarů brusnice chocholičnaté (Vaccinium corymbosum) a jejích kříženců. V teoretické části mé práce jsem se zabývala rodem Vaccinium se zaměřením na druh brusnice chocholičnatá a její kultivary. Dále jsem se věnovala charakteristice systémů mikrosatelitních markerů pro identifikaci kultivarů brusnice chocholičnaté. V experimentální části jsem se zabývala 2 mikrosatelitními systémy pro identifikaci kultivarů brusnice chocholičnaté. Jeden systém obsahuje 9 polymorfních mikrosatelitních lokusů a druhý systém zahrnuje 11 polymorfních mikrosatelitních lokusů. Oba systémy byly již jejich autory testovány a podle nich přinášely spolehlivě hodnotitelné produkty bez artefaktů. Po mém testování jsem vybrala 7 mikrosatelitů, které měly dobře hodnotitelné produkty. Testovala jsem DNA celkem 53 rostlin, mělo se jednat o 32 různých kultivarů brusnice chocholičnaté a jejích kříženců. Díky známým genotypům vybraných 7 mikrosatelitních lokusů se mi povedlo určit kultivary brusnice chocholičnaté celkem u 36 testovaných rostlin. Pouze u 22 rostlin jsem však ověřila, že původní název kultivaru opravdu odpovídá jeho genetickému profilu.

Abstract:

In my Master's thesis, I focused on microsatellite markers, which are used for the identification of highbush blueberry cultivars. The theoretical part of this thesis, it is focused on the genus Vaccinium. There are based mainly on cultivars of specie Vaccinium corymbosum. It is also focused on characteristics of microsatellite marker systems for the identification of highbush blueberry cultivars. In the experimental part of the thesis, it is based on two microsatellite systems which are used for the identification of highbush blueberry cultivars. One of them includes nine polymorphic microsatellite loci and the second one includes eleven polymorphic microsatellite loci. I have selected seven microsatellites which offered useful PCR product without artifacts. I have tested DNA of 53 plants which should have included 32 cultivars of highbush blueberries. I determined cultivars of highbush blueberries in 36 of tested plants. However, I have discovered that only 22 of tested plants correspond with their genetic profile.

Keywords

brusnice chocholičnatá, Vaccinium corymbosum, kultivar, mikrosatelit, DNA, PCR amplifikace, genetické markery

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 31. 7. 2023

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Molecular and Cell Biology / Molecular and Cell Biology