Anonymizácia neuromedicínských obrazových dát

Bc. Dominika Zemanovičová

Bakalářská práce

Anonymization of Neuorimaging Data

Abstract:

The subject of this bachelor thesis is the analysis of the effect of selected anonymization tools on the research processing of images from magnetic resonance imagining (MRI) for the MAFIL laboratory. The theoretical part introduces the basic concepts of neuromedical image processing and presents selected criteria, which are used to evaluate direct errors of the anonymization tools as well as their effect on further research processing of anatomical MRI images. The practical part includes the implementation of a console application that allows examination of the effect of anonymization tools for input image NIfTI data stored in the standardized BIDS format. This work aims to propose an optimal process of anonymizing MRI image data for the MAFIL laboratory. In the last part of this thesis, recommendations are formulated based on the results of the image analysis.

Abstract:

Predmetom predkladanej bakalárskej práce je analýza vplyvu anonymizačných nástrojov na výskumné spracovanie snímok zo zobrazovania magnetickou rezonanciou (MRI) laboratória MAFIL. Teoretická časť približuje základné koncepty spracovania neuromedicínskych dát a predstavuje zvolené kritériá, na základe ktorých sú vyhodnotené priame chyby anonymizačných nástrojov a ich vplyv na ďalšie výskumné spracovanie anatomických snímok MRI. Praktická časť práce zahŕňa implementáciu konzolovej aplikácie, ktorá umožňuje skúmať vplyv zvolených anonymizačných nástrojov na vstupné obrazové dáta formátu NIfTI, ktoré sú uložené v štandardizovanom formáte BIDS. Cieľom tejto práce je navrhnúť optimálny postup anonymizácie anatomických obrazových dát MRI pre laboratórium MAFIL. V poslednej časti práce sú zhodnotené výsledky analýzy týchto dát a formulované odporúčania.

Klíčová slova

FAIR data, MAFIL, neuroimaging, NIfTI, anatomical MRI anonymization, data science

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 28. 6. 2022
• Vedoucí: RNDr. Michal Růžička, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Ing. Tomáš Svoboda

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Aplikovaná informatika