Bc. Zuzana Dvořáková

Bakalářská práce

Výpočetní nástroj pro automatickou anotaci vnoření transposonů v genomech z NGS dat

An automatic pipeline for computational annotation of transposable element insertions in NGS data
Anotace:
Tato bakalářská práce se věnuje mobilním elementům (transposonům) v genomu a jejich vzájemnému vnořování. Cílem práce bylo vytvořit program, který bude vyhledávat taková vnoření v datech získaných metodami nového sekvenování (readech) bez potřeby skládání genomu. Vytvořený nástroj byl otestován na datech z kukuřice.
Abstract:
This bachelor thesis deals with mobile elements (transposons) in a genome and their mutual nesting. The aim was to create a program that will detect those nestings in next generation sequencing data (reads) without the need of genome assembly. Created tool was tested on data from corn.
 

Klíčová slova

NGS data transposony vnoření transposonů sekvenování nové generace
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2016
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/uszu3/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 24. 6. 2016
  • Vedoucí: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Oponent: RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce