Bc. Marko Vrábel

Master's thesis

Průzkum nesrovnalostí v datových souborech pro predikci vazebných míst RNA vázajících proteinů pomocí hlubokého učení.

Exploration of encoded sequence bias in benchmark datasets for RNA binding protein binding site prediction using deep learning.
Anotácia:
Pochopení mechanismů mnoha buněčných procesů vyžaduje identifikaci vazeb-ných míst RNA-vázajících proteinů (RVP), neboť hrají zásadní roli v genové regulaci. Bylo vyvinuto mnoho výpočetních technik, včetně modelů hlubokého učení, které se ukázaly jako vysoce účinné při identifikaci vazebných míst RVP. Všechny navržené metody však byly trénovány a vyhodnoceny na stejných referenčních souborech dat …viac
Abstract:
Understanding the mechanisms behind many cell processes requires an identification of the binding sites of RNA-binding proteins (RBPs), as they play crucial roles in gene regulation. Many computational techniques have been developed, including deep learning models, which have shown to be highly effective in identifying RBP binding sites. However, all the proposed methods have been trained and evaluated …viac
 
 
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 16. 6. 2022
  • Vedúci: PhD Panagiotis Alexiou
  • Oponent: Ph. D Nicolas Blavet

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta