Diverzita a evoluce dvou MHC genů třídy II v divokých populacích modelového druhu - myši domácí

Mgr. Dagmar Čížková, Ph.D.

Doctoral thesis

Diversity and evolution of two MHC class II genes in wild populations of a model species, the house mouse

Anotácia:

V této práci se věnujeme molekulárně-genetické charakterizaci dvou těsně vázaných genů MHC třídy II v divokých populacích myši domácí (Mus musculus). Srovnáváme signály selekce a míru diverzifikace mezi těmito geny a také mezi jejich ortology u dvou poddruhů myši domácí – M. m. domesticus a M. m. domesticus. Ukazujeme, že navzdory těsné vazbě, se oba geny liší ve studovaných parametrech jejich evoluce. Divergence mezi ortology těchto dvou genů je poměrně nízká a nic nenasvědčuje jejich možné úloze při speciaci mezi myšími poddruhy. Tato práce ukazuje, že studie MHC genů u volně žijících obratlovců mohou přinést podstatně odlišné výsledky v závislosti na studovaném MHC genu, a že míra polymorfismu u příbuzných druhů není vhodným kritériem výběru MHC genu.

Abstract:

In this thesis we analyse molecular-genetic characteristics of two closely linked MHC class II genes in wild populations of the house mouse (Mus musculus). We compare signals of selection and patterns of diversification between these two genes and between their orthologs in two house mouse subspecies, Mus m. musculus and Mus m. domesticus. We show that despite the close linkage, the two genes show disparate evolutionary patterns. Divergence between the orthologs at both loci is rather low and we find no indication of their possible role in the speciation between the two mouse subspecies. We conclude that studies on MHC genes in wild-living vertebrates can give substantially different results depending on the MHC gene examined and that the level of polymorphism in a related species is a poor criterion for gene choice.

Keywords

MHC, myš domácí, selekce, populační struktura, trans-species polymorfismus, house mouse, selection, population structure, trans-species polymorphism

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 9. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 11. 2015
• Vedúci: doc. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D.
• Oponent: prof. MVDr. RNDr. Petr Hořín, CSc., prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / odbor:
Biology (4-years) / General and Molecular Genetics