Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem – Bc. Náth Vozábal
Bc. Náth Vozábal
Bakalářská práce
Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem
Structure of TcdB Toxin Glycosyltransferase with Native Substrate
Anotace:
Tato bakalářská práce se zaměřuje na využití AlphaFoldu, programu pro predikci terciární struktury proteinů s využitím hlubokého učení a neuronových sítí, spolu se simulacemi molekulové dynamiky k in silico studiu experimentálně neznámého komplexu glykosyltransferázy toxinu TcdB a malé GTPásy RhoA. Nejprve se predikovaly modely pomocí AlphaFoldu, poté se komplex doplnil o substrát a kofaktory. Následně …víceAbstract:
This bachelor thesis focuses on the use of AlphaFold, a program for predicting tertiary structure of proteins using deep learning and neural networks, together with molecular dynamics simulations to study in silico an experimentally unknown complex of the glycosyltransferase toxin TcdB and the small GTPase RhoA. Models were first predicted using AlphaFold, then the complex was augmented with substrate …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2023
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/yglnm/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 28. 6. 2023
- Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Jan Novotný, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Bioinformatika