Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem – Bc. Náth Vozábal
Bc. Náth Vozábal
Bachelor's thesis
Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem
Structure of TcdB Toxin Glycosyltransferase with Native Substrate
Abstract:
Tato bakalářská práce se zaměřuje na využití AlphaFoldu, programu pro predikci terciární struktury proteinů s využitím hlubokého učení a neuronových sítí, spolu se simulacemi molekulové dynamiky k in silico studiu experimentálně neznámého komplexu glykosyltransferázy toxinu TcdB a malé GTPásy RhoA. Nejprve se predikovaly modely pomocí AlphaFoldu, poté se komplex doplnil o substrát a kofaktory. Následně …moreAbstract:
This bachelor thesis focuses on the use of AlphaFold, a program for predicting tertiary structure of proteins using deep learning and neural networks, together with molecular dynamics simulations to study in silico an experimentally unknown complex of the glycosyltransferase toxin TcdB and the small GTPase RhoA. Models were first predicted using AlphaFold, then the complex was augmented with substrate …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2023
Identifier:
https://is.muni.cz/th/yglnm/
Thesis defence
- Date of defence: 28. 6. 2023
- Supervisor: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Reader: Mgr. Jan Novotný, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Bioinformatics