Genetická analýza zapojení kandidátních proteinů do opravných drah poškození DNA

Michal STEIGER

Bakalářská práce

Genetic analysis of the candidate proteins' involvement in DNA damage repair pathways

Anotace:

Opravné dráhy poškození DNA jsou nezbytné pro udržení stability genomu organismů. I přes významný pokrok učiněný v pochopení fungování zmíněných drah zůstává mnoho proteinů zapojených do těchto procesů neidentifikovaných. Tato práce měla za cíl přispět k porozumění mechanismů opravných drah DNA studiem zapojení sedmi kandidátních proteinů u huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana). Semena linií huseníčku s homozygotní mutací v genu kódujícím daný protein byla podrobena testům s genotoxickými látkami, které vyvolávaly různé formy poškození DNA. Proteiny XYL1 a STUBL5 byly vyloučeny ze zapojení se do opravných drah. Heterozygotní linie BIC2-1/bic2-1 a STUBL5-1/stubl5-1 potenciálně obsahují další neidentifikovanou mutaci, což je potřeba potvrdit či vyvrátit v budoucích testech.

Abstract:

DNA damage repair pathways are essential for maintaining genome stability in organisms. Despite significant progress made in understanding the functioning of these pathways, many proteins involved in these processes remain unidentified. This thesis aimed to contribute to the understanding of DNA repair mechanisms by studying the involvement of seven candidate proteins in Arabidopsis thaliana. Seeds of Arabidopsis lines with homozygous mutations in the gene encoding the candidate protein were subjected to tests with genotoxic chemicals which induced various forms of DNA damage. Proteins XYL1 and STUBL5 were excluded from involvement in DNA repair pathways. Heterozygous lines BIC2-1/bic2-1 and STUBL5-1/stubl5-1 potentially bear additional unidentified mutations which needs to be confirmed or refuted in future tests.

Klíčová slova

Arabidopsis thaliana, BCP1, oprava DNA

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Jovanka Vladejić

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie