Proteomika cervikálního hlenu

Bc. Vendula RAŠKOVÁ

Diplomová práce

Proteomics of cervical mucus

Anotace:

Cílem diplomové práce je vývoj a optimalizace proteomické hmotnostně-spektrometrické analýzy cervikálního hlenu pro budoucí rutinní analýzu a statistická analýza se zaměřením hledání markeru receptivity endometria. K prostudování proteinů byly použity metody FASP separace, přečištění na C18 koloně ve špičkách, analýza Orbitrap Elite. Hodnoty intenzit byly měřeny u každého vzorku třikrát. Tyto triplety se statisticky vyhodnotily a byla vytvořena heat mapa zastoupení 29 proteinů v jednotlivých vzorcích a zároveň v jednotlivých tripletech, jejichž výskyt byl ovlivněn graviditou. Na heat mapě jsou rozeznatelné proteiny, jež se vyskytovaly převážně u pacientek, jimž se podařilo otěhotnět. Výskyt těchto proteinů se v jednotlivých vzorcích lišil a byl také odlišný i v rámci tripletu vzorku. Mezi proteiny identifikovaných u gravidních pacientek patřily: calpalin, galectin, hypoxia upregulated protein 1, aldo-keto reduktasa a kallistatin.

Abstract:

The aim of this thesis is examine and optimalization of mass spectrometric proteomic profiling cervical mucus for the rutine analysis and statistic research specialized on loading for the endometrium receptivity markers. Proteins were studied with the FASP separation, purufucation on C18 Stage Tips and Orbitrap Elite analysis. I used the optimized analysis on 11 samples of cervical mucus, which are known for their role in success/failure in vitro fertilization. Point on the scale of intensity of each sample was measured three times. These triplets were statisticaly evaluated and then the heat map of pattern representation of 29 proteins in each sample and each triplet created. These proteins we can see in the heat map and the way of their appearame is different not only in the individual samples, bus also on the triplets of samples in question. The group of proteins which were identificatified in the samples of pregrnat patiens containe following ones: calpalin, galectin, hypoxia up-regulated protein 1, aldoketo reduktasa a kallistatin.

Klíčová slova

cervikální hlen, mucin, FASP, SAX, MS, marker, heat mapa

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 7. 2015

Zveřejnit od: 23. 7. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Tomáš Oždian

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie