Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov. – Bc. Ján Tungli
Bc. Ján Tungli
Master's thesis
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Calculation of binding free energy profiles of protein-dimer formation.
Abstract:
Tato diplomová práce se zaměřuje na výpočet volné energie dimerizace proteinu 14-3-3 a změn v struktuře spojených s tímto procesem. Proteiny 14-3-3 jsou přítomné ve všech eukaryotických organismech. Objevují se v různych izoformách, které mohou tvořit homo- a hetero- dimery. Jejich funkce v biologických systémech jsou rozmanité a můžou vázat velke množství proteinů a ligandů. Rovnováha mezi monomermi …moreAbstract:
The present thesis focuses on the free energy calculation of 14-3-3zeta protein dimerization and the structural changes associated with this process. 14-3-3 proteins are ubiquitous in eukaryotic organisms. They appear in various isoforms, which can form homo- or hetero-dimers. Their functions in biological systems are diverse and they can bind a large number of proteins and ligands. The equilibrium …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2018
Identifier:
https://is.muni.cz/th/sx5hk/
Thesis defence
- Date of defence: 12. 6. 2018
- Supervisor: RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D.
- Reader: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Physics / Biophysics
Theses on a related topic
-
Tvorba komplexu heveinové domény HEV32 s oligosacharidy studovaná pomocí simulačních metod zlepšujících vzorkování
Jan Beránek -
Theoretical methods in calculation of hydration free energy of hydrophobic molecules
Jakub Smutek -
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Daniel Jaroň -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček -
Měření povrchové energie pevných látek a kapalin
Jiří Bilík -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Nucleation of water and argon in supersonic molecular beams by the molecular dynamics method
Martin Klíma