Asociační studie polymorfizmů vybraných genů aktivační kaskády rodiny transkripčních faktorů NF-kB a cytokinu IL-18 u nemocí spojených s atopií

MUDr. Marcel Schüller, Ph.D.

Disertační práce

Association studies of the polymorphisms in selected genes of the NF-kB family of transcription factors activation cascade and cytokine IL-18 in atopic diseases

Anotace:

Alergické nemoci spojené s atopií, jako jsou astma, alergická rýma nebo atopická dermatitida, patří z hlediska etiologie mezi multifaktoriální choroby, jejichž vznik je ovlivňován jak genetickou výbavou jedince, tak faktory vnějšího prostředí. Cílem práce bylo pomocí asociačních studií zjistit možné souvislosti polymorfizmů ve vybraných kandidátních genech s atopickými chorobami nebo dílčími projevy atopie ve vzorku české populace. Pomocí PCR a restrikční analýzy bylo studováno celkem 8 polymorfizmů v genech pro IKAP a NFKBIA, které se účastní aktivační kaskády transkripčního faktoru NF-kappaB, a 3 polymorfizmy v genu pro cytokin IL-18. Nenalezli jsme žádnou významnou asociaci polymorfizmů v genech pro IKAP a NFKBIA s atopickými chorobami. Naproti tomu byly v naší práci asociovány některé promotorové varianty (kombinace genotypů a haplotypy) genu pro IL 18 s alergickou rýmou a jeden z polymorfizmů významně souvisel s pozitivitou kožního prick-testu na plíseň Alternaria. Podle našich výsledků tak variabilita genu pro IL-18 může ovlivňovat genetickou predispozici k atopickým nemocem v české populaci.

Abstract:

Allergic diseases related to atopy like asthma, allergic rhinitis and atopic dermatitis belong to the multifactorial diseases, which are influenced by genetic and environmental factors. The aim of the study was to test for possible associations of the polymorphisms in selected candidate genes with atopy and related phenotypes in association studies in the Czech population sample. Using PCR and restriction analysis, 8 polymorphisms in the genes for IKAP and NFKBIA, involved in the NF-kappaB activation cascade, and 3 polymorphisms in the IL-18 gene were studied. No significant association of the polymorphisms in the IKAP and NFKBIA genes with atopic diseases were found. However, some promoter variants (combinations of genotypes and haplotypes) of the IL-18 gene were associated with allergic rhinitis and one of the polymorphisms alone was associated with the pozitivity of the prick-test to the mold Alternaria in our study. Thus, our results suggest the role of the variability in the IL-18 gene in the genetic predisposition to atopic diseases.

Klíčová slova

NF-kappaB, IKAP, NFKBIA, IL-18, atopie, alergie, astma, alergická rýma, asociační studie, genový polymorfizmus NF-kappaB, atopy, allergy, asthma, allergic rhinitis, association study, gene polymorphism

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 7. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 3. 7. 2007
• Vedoucí: prof. MUDr. Lydie Izakovičová Hollá, Ph.D.

Masarykova univerzita

Lékařská fakulta

Doktorský studijní program / obor:
Všeobecné lékařství / Fyziologie a patologická fyziologie