Metodika bioinformatické analýzy dat ze sekvenování nové generace typu RNA-seq – Mgr. Matej Hajnal
Mgr. Matej Hajnal
Bachelor's thesis
Metodika bioinformatické analýzy dat ze sekvenování nové generace typu RNA-seq
Bioinformatic analysis of RNA-Seq next-generation sequencing data
Abstract:
The target of this Bachelor's thesis is bioinformatic analysis of next-generation sequencing data obtained from HEK293 cells. cDNA library sequencing allows to compare RNA-seq profile between conditions and therefore had been chosen to determine role of human ZCCHC9 protein by coding gene down-regulation. For this intention has been created workflow, which was used to analyse data and discover differentially …moreAbstract:
Cieľom tejto bakalárskej práce je bioinformatická analýza dát sekvenácie novej generácie cDNA knižnice buniek HEK293. Sekvenácia cDNA knižnice umožňuje porovnať RNA-seq profil medzi podmienkami a bola preto vybraná pre určenie významu ľudského proteínu ZCCHC9 zníženou expresiou kódujúceho génu. Pre tento zámer bol vytvorený postup práce k analýze dát a odhaleniu rozdielnej expresie génov.
Language used: Slovak
Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 5. 2013
Identifier:
https://is.muni.cz/th/g53yk/
Thesis defence
- Date of defence: 18. 6. 2013
- Supervisor: doc. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
HAJNAL, Matej. \textit{Metodika bioinformatické analýzy dat ze sekvenování nové generace typu RNA-seq}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics. 2013. Available from: https://theses.cz/id/aixmal/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.