Optimalizace kryořezů Danio rerio pro zobrazovací hmotnostní spektrometrii

Žaneta Koudelková

Bakalářská práce

Optimization of Danio rerio cryosections for mass spectrometry imaging

Anotace:

Zobrazovací hmotnostní spektrometrie (MALDI MSI) je v současnosti hojně používaná pro stanovení a mapování přítomnosti biomolekul jako jsou proteiny, peptidy, nukleové kyseliny a lipidy. V této práci byla provedena optimalizace kryořezů pro tuto metodu za použití Danio rerio jako modelového organismu. V optimalizaci byly použity 3 různé tloušťky řezů: 15, 20 a 25 µm a 2 typy zalévacích médií: směs 2% karboxymethylcelulózy a 10% želatiny a komerčně dostupné médium CryoGlue. Jejich porovnání bylo založeno na sledování dosažené intenzity signálů. Vzhledem k potenciálu Danio rerio k využití v ekotoxikologických studiích, je v této práci obsaženo i srovnání kontrolního řezu jedince a řezu jedince ovlivněného stříbrnými nanočásticemi.

Abstract:

In recent years, a matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI MSI) is abundantly used for determination and mapping of biomolecules such as peptides, proteins, nucleic acids and lipids. In this thesis the optimization of cryosection for mass spectrometry using Zebrafish was carried out. Sections’ thicknesses 15 μm, 20 μm and 25 μm and two embedding media, a mixture of 2% carboxymethylcellulose and 10% gelatine and a commercial medium CryoGlue, were used in this optimization. Their comparison was based on monitoring reached intesities of peaks. Due to possible utilization of Zebrafish as a model organism for ecotoxicology studies, this thesis contains also a comparison of a control section with a varinat treated with silver nanoparticles.

Klíčová slova

MALDI MSI, Danio rerio, zalévací médium, kryořezy, nanočástice

Keywords

MALDI MSI, Zebrafish, cryosections, embedding medium, nanoparticles

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Roman Guráň, Ph.D.
• Oponent: Vladimír Vrkoslav, Ph.D.

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Agrobiologie / Molekulární biologie a biotechnologie