Registrace obrazů buněk podle intenzit v obraze

Bc. Ondřej Daněk, Ph.D.

Master's thesis

Voxel-based registration of images of cells

Anotácia:

Práce se věnuje registraci obrazů buněk pouze na základě intenzit obsažených v obrazech, tedy bez využití uměle vytvořených, či jinak dodaných, registračních značek. Je prezentováno několik podobnostních mír použitelných pro tento způsob registrace a tyto míry jsou podrobně zkoumány a porovnávány s ohledem na jejich využitelnost při registraci dat dodaných Centrem pro analýzu biomedicínských obrazů Fakulty informatiky Masarykovy univerzity v Brně. Dále jsou testovány algoritmy pro globální optimalizaci (nalezení minima nebo maxima) těchto funkcí, přičemž je kladen důraz na přesnost a rychlost zpracování. Součástí práce je také vytvoření registrační knihovny implementující všechny výše uvedené algoritmy a její podrobná dokumentace.

Abstract:

This thesis is devoted to voxel-based registration of images of cells supplied by the Center for Biomedical Image Analysis by the Faculty of Informatics at Masaryk University. Similarity functions usable for this type of image registration are presented and compared according to their speed, accuracy and other charakteristics. Also the methods for optimization of these functions (minimizing or maximizing) are discussed. Library implementing all mentioned methods and algorithms is also a part of the thesis.

Kľúčové slová

registrace obrazů, podobnostní funkce, vzájemná informace, Fourierova transformace, optimalizace

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 1. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 2. 2007
• Vedúci: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / odbor:
Informatics / Informatics