Význam stanovení vybraných znaků pomocí PCR metod v tekuté biopsii pacientů s karcinomem prostaty

Bc. Adriana CILEČKOVÁ

Diplomová práce

The importance of evaluation of selected markers using PCR methods in a liquid biopsy of prostate cancer patients.

Anotace:

Diplomová práce se zabývá významem stanovení vybraných znaků pomocí PCR metod v tekuté biopsii pacientů s karcinomem prostaty. V teoretické části jsou shrnuty poznatky nejen o prostatě, karcinomu prostaty, jeho kastračně rezistentní formě, ale také o androgenovém receptoru (AR), kvantitativní PCR v reálném čase (qPCR), digitální PCR (ddPCR) a tekuté biopsii. Pro samotnou práci byla stěžejní kultivace buněčných linií VCaP a LNCaP a potvrzení přítomnosti amplifikace u VCaP. Dále byly provedeny experimenty za účelem analýzy počtu kopií genů androgenového receptoru a zesilovače transkripce androgenového receptoru u vybraných buněčných linií s využitím qPCR a ddPCR. Byla rovněž provedena pilotní analýza počtu kopií androgenového receptoru pomocí ddPCR ve volné cirkulující DNA pacientů s pokročilým karcinomem prostaty.

Abstract:

The diploma thesis deals with the importance of evaluation of selected markers using PCR methods in a liquid biopsy of prostate cancer patients. The theoretical part of this thesis summarizes the knowledge not only about the prostate, prostate cancer, its castration-resistant form, but also about the androgen receptor (AR), quantitative real-time PCR (qPCR), droplet digital PCR (ddPCR) and liquid biopsy. Cultivation of VCaP and LNCaP cell lines and confirmation of the presence of AR amplification in VCaP were crucial to the work itself. Next experiments were performed to analyze the copy number of the androgen receptor and its enhancer in selected cell lines using qPCR and ddPCR. Preliminary ddPCR analysis of the androgen receptor was also performed in cell-free DNA of patients with advanced prostate cancer.

Klíčová slova

karcinom prostaty, tekutá biopsie, nádorové buňky, PCR metody, androgenový receptor

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 8. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 1. 9. 2021
• Vedoucí: doc. Mgr. Jan Bouchal, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie