Cell-free DNA a její význam při diagnostice a léčbě lymfoidních malignit.

Lucie FRYŠTÁKOVÁ

Bakalářská práce

The importance of Cell-Free DNA in diagnostic and treatment of lymphoid malignancies.

Anotace:

Tato práce se zabývá cell-free DNA (cfDNA) a jejím významem při diagnostice a léčbě lymfoidních malignit. CfDNA je DNA tvořená volně cirkulujícími DNA fragmenty uvolňovanými do krevního řečiště přímo z nádorových buněk. Jelikož je cfDNA uvolňována do krve z různých oblastí nádoru, odráží jeho heterogenitu, čehož využíváme při tekuté biopsii, která se jeví jako vhodná alternativa klasické biopsie. CfDNA ukázala svůj potenciál jako minimálně invazivní biomarker pro časnou diagnostiku řady malignit, její význam u hematologických chorob je intenzivně studován. V této práci byla nejprve provedena izolace cfDNA, následně byla stanovena její koncentrace pomocí dvou metod - přístroje Qubit fluorometru 2.0 a kitu Qubit dsDNA HS Assay, pro porovnání byla provedena také kvantifikace pomocí technologie Sybrgreen koncentrační křivkou housekeeping genů s využitím primerů pro 2-microglobulin a -actin. Poté byly sledovány změny hladiny koncentrace cfDNA vybrané skupiny pacientů s lymfoproliferativním onemocněním (DLBCL, HL). Získaná data byla statisticky zpracována a porovnána s daty klinickými.

Abstract:

The presented thesis aimed a cell-free DNA (cfDNA) and its importance in diagnostics and treatment of lymphoid malignancies. CfDNA is a DNA formed by freely circulating DNA fragments released into the bloodstream directly from tumor cells. CfDNA is released into the blood from different areas of the tumor andit reflects its heterogeneity, which can be used in liquid biopsy, as a suitable alternative to a classical biopsy. CfDNA has shown its potential as a minimally invasive biomarker for early diagnostics of a number of malignancies. Importance of cfDNA in hematological diseases is intensively studied. In this work, cfDNA was isolated, then the concentration was determined by two methods - Qubit fluorometer 2.0 and Qubit dsDNA HS Assay kit. For comparison, quantification was also performed using Sybrgreen technology with a concentration curve of housekeeping genes using primers for 2 microglobulin and actin. Changes in the levels of cfDNA concentration in a selected group of patients with lymphoproliferative disease (DLBCL, HL) were monitored. The obtained data were statistically processed and compared with clinical data.

Klíčová slova

cfDNA, NHL, DLBCL, HL, tekutá biopsie

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 8. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Martina Divoká, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie