Zpět na vyhledávání

Alfred EMIRI

Bachelor's thesis

Elucidation of the retrograde transport of contact-dependent inhibition (CDI) toxins through bacterial SecYEG translocon complex

Identification of the driving force behind retrograde transport of contact-dependent inhibition toxins through bacterial SecYEG translocon complex
Abstract:
This study investigates the retrograde translocation of CdiA toxins through the bacterial SecYEG translocon, focusing on the unfolding of the effector domain, proven to be essential for successful transport through the translocon's narrow channel. Using molecular dynamics simulations, the research highlights the pivotal role of pH in influencing the domain unfolding. Additionally, a novel smFRET-adapted …more
Abstract:
This study investigates the retrograde translocation of CdiA toxins through the bacterial SecYEG translocon, focusing on the unfolding of the effector domain, proven to be essential for successful transport through the translocon's narrow channel. Using molecular dynamics simulations, the research highlights the pivotal role of pH in influencing the domain unfolding. Additionally, a novel smFRET-adapted …more
 

Keywords

CDI toxins CdiA toxin SecYEG retrograde transolation Alphafold2 molecular simulations GROMACS umbrella sampling smFRET FRETBursts
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2024

Thesis defence

  • Supervisor: Mgr. Tomáš Fessl, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

EMIRI, Alfred. Elucidation of the retrograde transport of contact-dependent inhibition (CDI) toxins through bacterial SecYEG translocon complex. České Budějovice, 2024. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=70191 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biological Chemistry / Biological Chemistry

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses avdw7l avdw7l/2
9/5/2024
Folders
Files
thesis Emiri_Alfred_2024_BT.pdf
Bulánová, L.
10/5/2024

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.