Molekulární fylogeneze a genetická diverzita krytosemenných rostlin

Julie Sobotková

Bakalářská práce

Molecular phylogeny and genetic diversity of angiosperms

Anotace:

Práce se zabývá molekulární analýzou jaderné oblasti ITS a chloroplastových oblastí matK a rbcL studované skupiny rostlin. Do experimentu byli zahrnuti zástupci čeledi Microteacae. Tato čeleď byla stanovena samostatnou v roce 2016 a náleží do řádu Caryophyllales. Z herbářových položek byla izolována DNA a následně byly pomocí PCR amplifikovány sledované oblasti. Automatickým sekvenováním byly získány výsledné sekvence, které byly poté editovány a statisticky vyhodnoceny. Ze získaných hodnot byla stanovena nejvariabilnější oblast ITS. Posledním krokem byla konstrukce fylogenetických stromů s využitím sekvencí všech oblastí. Bylo zjištěno, že rod Microtea je monofyletický a tvoří ho dvě vývojové linie (klady).

Abstract:

The thesis deals with molecular analysis of nuclear region ITS and chloroplast regions matK and rbcL in study of particular group of plants. Reprezentatives of the Microteaceae were included in the experiment. This family was set up separately in 2016 and belongs to the order Caryophyllales. DNA was isolated from the herbarium items and the regions were amplified by PCR. The resulting sequenes were obtained by automatic sequencing and then was edited and statistically evaluated. Of the values obtained the most variable region of ITS was determined. The last step was the construction of phylogenetic trees using sequences of all regions. It was found that genus Microtea is mohophyletic and consists of two evolutionary lines (clades).

Klíčová slova

Microtea, PCR, sekvenování, fylogenetika, ITS, matK, rbcL

Keywords

phylogenetics, Microtea, sequencing, ITS, rbcL, matK, PCR

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Pavel Hanáček, Ph.D.
• Oponent: Michaela Ludvíková, externi

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Agrobiologie / Molekulární biologie a biotechnologie