Zpět na vyhledávání

Bc. Martin Pernica

Master's thesis

GPU akcelerace spojitého zpřesňování natočení obrázků v Xmipp

GPU acceleration of the continuous refinement of the alignment parameters in Xmipp
Abstract:
Cílem této práce bylo zrychlení programu z balíčku Xmipp. Jde o výpočet spojitého zpřesňování natočení obrázků vzhledem k prostorovému modelu biomolekuly ve Fourierově prostoru. Ve srovnání s paralelní CPU implementací se podařilo dosáhnout 9,3násobného zrychlení za použití GPU akcelerace. Akcelerovaná verze bude integrována do balíčku Xmipp.
Abstract:
The goal of this thesis was to accelerate program from Xmipp bundle, which continuously refines angles of images with respect to 3D model of a biomolecule. In comparison to original parallel CPU version the GPU accelerated version achieved 9,3 times speedup. Accelerated version will be integrated to Xmipp bundle.
 

Keywords

CUDA GPU akcelerace Xmipp kryoelektronová mikroskopie
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 21. 5. 2024
Identifier: https://is.muni.cz/th/bkn86/

Thesis defence

  • Date of defence: 18. 6. 2024
  • Supervisor: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
  • Reader: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / field:
Artificial intelligence and data processing / Big data

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.