Průkaz a charakterizace Escherichia coli rezistentní ke klinicky významným skupinám antibiotik u racků

Bc. Michaela Růžičková

Master's thesis

Detection and characterisation of Escherichia coli resistant to clinically important antibiotics in gulls

Abstract:

Rezistence bakterií k antibiotikům představuje významný problém v léčbě infekčních onemocnění zvířat i člověka. Rezistentní bakterie selektované používáním antibiotik v humánní a veterinární medicíně se snadno šíří do prostředí a jejich prevalence rok od roku narůstá. Ze zastavěných oblastí se pak roznáší dál do neurbanizované krajiny, kde mohou kolonizovat volně žijící zvířata, která se v kontaminované přírodě pohybují. Cílem práce je zhodnotit výskyt rezistentních bakterií u volně žijících zvířat, konkrétně populace racků stříbřitých (Larus argentatus), kteří představují synantropní druh a mohou zrcadlit míru znečištění prostředí rezistentními bakteriemi pocházejícími z lidských aktivit. V rámci této práce bude proveden průkaz enterobakterií rezistentních ke klinicky významným skupinám antibiotik za využití metod mikrobiologie a molekulární biologie. Práce dokazuje výskyt bakterií rezistentních k antibiotikům používaných v humánní i veterinární medicíně v přírodě a u zvěře, která se s antibiotiky a rezistentními bakteriemi setkává až sekundárně v důsledku lidské činnosti. Dále také poukazuje na vysoké počty multirezistentních bakterií, tedy těch vykazujících rezistenci na více antibiotik současně, čímž potvrzuje kritický a stále vzrůstající trend ve výskytu antibiotické rezistence.

Abstract:

Antibiotic resistance causes significant problems in treating infectious diseases of both animals and humans. Resistant bacteria selected by using antibiotics in human and veterinary medicine spread easily into the environment, and their prevalence is increasing with every new year. The bacteria then disperse from urban areas to non-urbanised ones, where they potentially colonise wild animals, which live in the contaminated habitat. The purpose of this thesis is to assess the occurrence of resistant bacteria in wild animals, focusing on population of European herring gulls (Larus argentatus), which represents a synanthropic species and can mirror the extent of environment pollution by resistant bacteria originating from human activities. Within the thesis, enterobacteria resistant to important groups of antibiotics will be determined using methods of microbiology and molecular biology. This thesis proves the presence of bacteria resistant to antibiotic substances administered in human and veterinary medicine in nature and in animals, which encounter antibiotics and resistant bacteria only secondarily as a result of human activity. It also points out the high numbers of multi-resistant bacteria, i.e. those showing resistance to multiple antibiotics simultaneously, thus confirming the critical and ever-increasing trend of antibiotic resistance.

Keywords

gram-negativní bakterie, antibiotická rezistence, β-laktamová antibiotika, fluorochinolony, volně žijící ptactvo, racci, gram-negative bacteria, antibiotic resistance, β-lactam antibiotics, fluroquinolones, wild birds, gulls

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 6. 2021

Thesis defence

• Date of defence: 14. 7. 2021
• Supervisor: doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D.
• Reader: prof. MVDr. Alois Čížek, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Microbiology / Microbiology