Symbiotické bakterie sladkovodní mechovky Pectinatella magnifica

Martin Kadlec

Bachelor's thesis

Symbiotic bacteria of fresh water bryozoan Pectinatella magnifica

Abstract:

Nedílnou součást vodního společenství po celém světě tvoří mikroskopičtí koloniální živočichové z kmenu Mechovky (Bryozoa), kam se řadí i bochnatka americká (Pectnitalla magnifica). Kmen Bryozoa se v současné době dělí do tří tříd, Pectinatella magnifica tvořící přisedlé kolonie houbovitého vzhledu spadá do nejméně početné třídy sladkovodních mechovek Phylactolamneata. Pectinatella magnifica se stále častěji objevuje na území České republiky, jedná se o invazivní druh mechovky pocházející ze Severní Ameriky. Na rozdíl od mořských mechovek, u kterých již byla publikována řada studií zabývajících se mikrobiologickými aspekty těchto živočichů, jsou sladkovodní mechovky nejméně prozkoumané. Prozatím neexistují studie zabývající se výzkumem symbiotických bakterií bochnatky americké. Cílem této práce bylo kultivační stanovení symbiotických bakterií organismu Pectinatella magnifica, jejich morfologická kontrola a příprava izolátů pro následnou podrobnou identifikaci. Za tímto účelem byly asepticky odebrány vzorky bochnatky americké ze čtyř lokalit v jižních Čechách, které byly následně v laboratoři zpracovány pro kultivační stanovení bakterií. Zvlášť byla odebírána povrchová vrstva obsahující zooidy a zvlášť gelová hmota nacházející se uvnitř kolonií mechovky. Bakterie byly stanovovány kultivačně za anaerobních a aerobních podmínek. Po stanovení počtů bakterií následovala jejich morfologická kontrola za využití fázové kontrastní mikroskopie a následně bylo vybráno několik charakteristických vzorků pro přípravu na podrobnou identifikaci pomocí sekvenace 16S rDNA a hmotnostní spektrometrie MALDI-TOF. Kultivační stanovení bakterií odhalilo fakt, že více bakterií se nachází v povrchové vrstvě kolonií mechovky než ve vnitřní gelové hmotě, morfologická kontrola odhalila častější výskyt tyčinkovitých bakterií, z nichž téměř polovina byla pohyblivá.

Abstract:

Pectinatella magnifica is included in the phylum Bryozoa, which is represented by microscopic colonial animals, forming an integral part of water environment all over the world. The phylum Bryozoa is currently divided into three classes, Pectinatella magnifica forming sessile colonies of fungal appearance is included in the class of freshwater bryozoans called Phylactolamneata. Currently there is growing frequency of the occurrence of Pectinatella magnifica in Czech Republic, therefore it is considered to be an invasive animal with its origin in North America. In the difference of sea-water bryozoans, which have been in the center of interest of many microbiological studies, the study of microbiological aspects of fresh water bryozoans was until now left out. In the presence there are no studies dedicated to investigation of symbiotic bacteria of the organism Pectinatella magnifica. The object of this work was the enumeration of bacteria associated with Pectinatella magnifica, the morphological analysis of the bacteria isolated and the preparation of the bacterial samples for further identification. To this purpose samples of Pectinatella magnifica were recovered from 4 locations in South Bohemia. Superficial parts of colonies contained zooids were collected separately from the inner gelled mass. Symbiotic bacteria were enumerated after cultivation in aerobic and anaerobic conditions. Enumeration of bacteria was followed by morphological analysis using the phase contrast microscopy. Results of microscopy labor were used for the selection of characteristic samples that has been processed for the detailed identification by sequencing of 16S rDNA and mass spectrometry MALDI-TOF. The enumeration of bacteria revealed that more bacteria are found in the superficial layer of colonies then inner gelled mass, the results of morphological analysis discovered major occurrence of rod shaped bacteria and the fact that almost half of this rod shaped bacteria were motile.

Keywords

Mechovky, Pectinatella magnifica, symbiotické bakterie, kultivace

Keywords

Bryozoa, Pectinatella magnifica, cultivation, symbiotic bacteria

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: prof. Ing. Eva Vlková, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Bachelor programme / field:
Animal Science / Companion Animals