Interakce kaspáz s OspC proteinem B. burgdorferi s.l.

Bc. Nikola Křapová

Diplomová práce

Caspase interaction with OspC protein B. burgdorferi s.l.

Anotace:

OspC protein je vysoce variabilní lipoprotein vyskytující se na povrchu bakterie Borrelie, původce onemocnění Lymeská borelióza. Hlavní roli hraje ve fázi diseminace bakterie do těla hostitele. Některé OspC typy jsou přímo asociovány s invazivitou. V bioinformatické analýze byly OspC typy rozděleny do skupin na invazivní a neinvazivní a nalezeny rozdíly. Z analýzy vyplynuly dva konzervované motivy XVTD a XATD odlišné pro jednotlivé skupiny. Zároveň bylo zjištěno, že by mohly být tyto motivy rozpoznány enzymy kaspázami. Na základě této analýzy byla vypracovaná experimentální část, ve které byla provedena inhibice a štěpení efektorovými kaspázami – 3, – 6 a – 7. U rozdílných motivů v rámci skupin, byl předpokládán rozdílný efekt v působení. Potvrdilo se nám štěpení pro kaspázu – 7 a jeden OspC typ (TTAD). Inhibice vycházela nekonzistentně.

Abstract:

OspC (outer surface protein C) is high variable lipoprotein which is located on the surface of bacteria Borrelia, causative agent of Lyme disease. This protein plays major role during dissemination into the host. Some OspC types are associated with invasiveness. In bioinformatics part OspC types were divided into invasive and non-invasive groups and then some differences were discovered. The analysis showed two conserved motifs XVTD and XATD which were different for individual groups. These motifs could be recognized by caspases. On the base of this analysis, the inhibition and cleavage assays were processed with executioner caspases – 3, – 6 a – 7. Different effects in interaction were expected on the base of different motifs. Cleavage by caspase – 7 was verified with one OspC type (TTAD motif). Inhibition assay was inconsistent.

Klíčová slova

Borrelie, Vnější povrchový protein C, invazivní, neinvazivní, kaspázy, štěpení, inhibice, Borrelia, Outer surface protein C, invasive, noninvasive, caspases, cleavage, inhibition

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 6. 2017
• Vedoucí: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Analytická biochemie