Genomická a transkriptomická analýza vybraných genů aktivních při vývoji osemení hrachu (Pisum sativum L.)

Bc. Helena ŠTEFANOVÁ

Master's thesis

Genomic and transcriptomic analysis of selected genes active in the development of the seed coat of pea (Pisum sativum L.)

Anotácia:

Dormance semen je jedním ze dvou klíčových domestikačních znaků bobovitých rostlin. V přirozeném prostředí je ukončení dormance regulováno vnějšími podmínkami, především teplotou a dostupností vody. U kulturních forem byla dormance odstraněna, umožňující tak rychlé klíčení po vysetí a zároveň také bobtnání semen v souvislosti s vařivostí a následnou stravitelnost. V případě semen bobovitých rostlin se jedná o fyzikálně podmíněnou dormanci zprostředkovanou propustností osemení pro vodu. Cílem této práce je molekulární analýzu genů identifikovaných pomocí diferenciální transkriptomické analýzy dormantních a nedormantních genotypů mapovací populace hrachu (Pisum L.). Bude sledována exprese vybraných kandidátních genů pomocí kvantitativní RT-PCR, prováděno jejich genetické mapování v kombinaci s analýzou fenotypového projevu na úrovni bobtnání a klíčení semen kontrastních linií hrachu.

Abstract:

Dormancy is one of two key domestication syndromes of Fabaceae. In the natural environment the termination of dormancy is regulated by external conditions, especially temperature and water availability. Dormancy was removed in cultural forms, thereby allowing the rapid germination after sowing and simultaneously swelling the seeds with regard to a cooking and subsequently digestion. In the case of seeds of Fabaceae it is a physically conditioned dormancy, mediated by a testa permeability for water. The aim of this is molecular analysis of genes identified by differential transcriptomic analysis dormant and non-dormant genotypes of mapping population of pea (Pisum sativum L.). Expression of selected candidate genes will be monitored by quantitative RT-PCR, the genetic mapping in combination with analysis of phenotypic expression at the level of swelling and germination of contrasting lines of pea will be performed.

Kľúčové slová

luskoviny, domestikace, dormance, klíčení, osemení (testa), Pisum

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: doc. Ing. Petr Smýkal, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular and Cell Biology