Dmytro SHUMLIANSKYI

Bachelor's thesis

Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies

The recent technologies in DNA sequencing like nanopore and PacBio allow direct sequencing of long single strands of DNA without amplification. This opens the path to a much improved environmental genome sequencing of bacteria, archaea and viruses. However, our DNA extraction methods have not been tested and updated for these new technologies.
Abstract:
Nucleic acid extraction is one of the basic procedures in molecular biology, allowing isolating of RNA and DNA from biological samples. This process, known as total nucleic acid extraction, enables various downstream applications encompassing gene expression analysis, genotyping, sequencing, and pathogen detection. However, current methods for generating high-quality and high-molecular-weight nucleic …more
Abstract:
Nucleic acid extraction is one of the basic procedures in molecular biology, allowing isolating of RNA and DNA from biological samples. This process, known as total nucleic acid extraction, enables various downstream applications encompassing gene expression analysis, genotyping, sequencing, and pathogen detection. However, current methods for generating high-quality and high-molecular-weight nucleic …more
 

Keywords

Nucleic acid extraction third-generation sequencing soil
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 12. 2023

Thesis defence

  • Supervisor: MSc. Roey Angel, Dr. rer. nat.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

SHUMLIANSKYI, Dmytro. Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies. České Budějovice, 2023. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=73915 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biological Chemistry / Biological Chemistry

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses bdoxi6 bdoxi6/2
15/12/2023
Folders
Files
thesis Shumlianskyi_Dmytro_2023_BT.pdf
Bulánová, L.
16/12/2023

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.