Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies – Dmytro SHUMLIANSKYI
Dmytro SHUMLIANSKYI
Bachelor's thesis
Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies
The recent technologies in DNA sequencing like nanopore and PacBio allow direct sequencing of long single strands of DNA without amplification. This opens the path to a much improved environmental genome sequencing of bacteria, archaea and viruses. However, our DNA extraction methods have not been tested and updated for these new technologies.
Abstract:
Nucleic acid extraction is one of the basic procedures in molecular biology, allowing isolating of RNA and DNA from biological samples. This process, known as total nucleic acid extraction, enables various downstream applications encompassing gene expression analysis, genotyping, sequencing, and pathogen detection. However, current methods for generating high-quality and high-molecular-weight nucleic …viacAbstract:
Nucleic acid extraction is one of the basic procedures in molecular biology, allowing isolating of RNA and DNA from biological samples. This process, known as total nucleic acid extraction, enables various downstream applications encompassing gene expression analysis, genotyping, sequencing, and pathogen detection. However, current methods for generating high-quality and high-molecular-weight nucleic …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 12. 2023
Obhajoba závěrečné práce
- Vedúci: MSc. Roey Angel, Dr. rer. nat.
Citační záznam
Citace dle ISO 690:
SHUMLIANSKYI, Dmytro. \textit{Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies}. Online. Bakalárska práca. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Faculty of Science. 2023. Dostupné z: https://theses.cz/id/bdoxi6/.
Jak správně citovat práci
SHUMLIANSKYI, Dmytro. Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies. České Budějovice, 2023. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakultaUNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE
Faculty of ScienceBachelor programme / odbor:
Biological Chemistry / Biological Chemistry
Práce na příbuzné téma
Názov
Vložil
Vložené
Práva
Složky
Soubory
Bulánová, L.
16. 12. 2023