Selekce a analýza fluorescenčních markerových linií ječmene setého (Hordeum vulgare)

Bc. Hana KRIŽŇANSKÁ

Master's thesis

Selection and analysis of fluorescent marker lines of barley (Hordeum vulgare)

Abstract:

V této diplomové práci jsem se zaměřila na selekci a charakterizaci fluorescenčních markerových linií ječmene setého (Hordeum vulgare), oblíbeného modelové organismu pro studium obilovin. Teoretická část je věnována charakteristice ječmene setého (Hordeum vulgare) a jeho genomu, dále popisu principu transformace rostlin se zaměřením na obiloviny, a na závěr translačně-fúzním fluorescenčním markerovým rostlinným liniím a jejich výhodám a omezením vyplývající z použití fluorescenčních proteinů. V rámci experimentální části byla provedena selekce transgenních rostlin regenerujících z embryonálního kalusu ječmene setého po transformaci nezralých embryí ječmene pomocí Agrobacterium tumefaciens, jejich genotypizace a následně charakterizace vybraných fluorescenčních markerových linií ječmene setého pomocí segregační analýzy a mikroskopie. U vybrané rostliny linie RFP-CEHN3/S2-1 byla zamapována pozice vložení T-DNA do genomu této rostliny pomocí metody inverzní PCR a následné bioinformatické analýzy.

Abstract:

In this master's thesis, I focused on the selection and characterization of the fluorescent marker lines of barley (Hordeum vulgare), a popular model organism for the study of cereals. The theoretical part is devoted to the characteristics of barley (Hordeum vulgare) and its genome, the description of the principle of plant transformation with a focus on cereals, and finally translational-fusion fluorescent marker plant lines and their advantages and limitations resulting from the use of fluorescent proteins. In the experimental part, the selection of transgenic plants regenerating from the embryonic callus of barley after the transformation of immature barley embryos using Agrobacterium tumefaciens was done followed by their genotyping and subsequent characterization of the selected fluorescent barley marker lines using segregation analysis and microscopy. In the selected plant of the RFP-CEHN3/S2-1 line, the position of T-DNA insertion into the genome of this plant was mapped using the inverse PCR method and the subsequent bioinformatics analysis.

Keywords

ječmen, fluorescenční protein, fluorescenční markerová linie, T-DNA

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 29. 4. 2022

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Kateřina Kaduchová

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology