Vyhledávání sekvenčních vzorů v okolí sekvencí DNA podporujících tvorbu G-kvadruplexů – Timotej Šujan
Timotej Šujan
Bachelor's thesis
Vyhledávání sekvenčních vzorů v okolí sekvencí DNA podporujících tvorbu G-kvadruplexů
Detection of sequence patterns in the vicinity of potential G-quadruplex sequences
Abstract:
Cílem této bakalářské práce je vytvořit nástroj, který dokáže systematickou analýzou sekvencí odhalit sekvenční vzory, které se vyskytují v blízkém okolí G-kvadruplexů častěji než v jiných sekvencích, a poté s jeho pomocí analyzovat tyto vzory u některých druhů rostlin. Nástroj je implementován jako desktopová aplikace v jazyce Java. Skrze ni může uživatel ze vstupního souboru sekvencí DNA nalézt shluky …moreAbstract:
The aim of this bachelor thesis is to create a tool that can systematically analyze sequences to detect sequence patterns that occur in the vicinity of G-quadruplexes more often than in other sequences, and then use it to analyze these patterns in some plant species. The tool is implemented as a desktop application in Java. Through it, the user can find clusters of similar G-quadruplex vicinities from …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 7. 2020
Identifier:
https://is.muni.cz/th/yk8ny/
Thesis defence
- Date of defence: 22. 9. 2020
- Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
ŠUJAN, Timotej. \textit{Vyhledávání sekvenčních vzorů v okolí sekvencí DNA podporujících tvorbu G-kvadruplexů}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics. 2020. Available from: https://theses.cz/id/bo951w/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.