Bc. Jiří Klimeš

Master's thesis

Výpočet obsahu a objemu molekulárního povrchu

Calculation of surface area and volume of molecules
Abstract:
Cílem této diplomové práce je vytvořit dva programy, jeden pro výpočet na CPU, druhý, paralelizovaný, pro výpočet na GPU, implementující efektivní algoritmus výpočtu objemu a obsahu molekulárního solvent-excluded (SES) povrchu. V textu práce se nachází představení historie a významu molekulárních povrchů a jejich analytická definice. Dále jsou zde probrány implementační detaily obou programů, včetně …more
Abstract:
The goal of this thesis is to create two programs, one for calculation on CPU, the other for calculation on GPU, which implement an effective algorithm for the calculation of the volume and surface area of the solvent-excluded (SES) molecular surface. The history and the importance of the molecular surfaces are discussed in the thesis and the analytical definition of the molecular surface is also defined …more
 

Keywords

OpenCL C++ .NET molekulární povrch paralelní výpočet solvent-excluded povrch výpočet objemu výpočet povrchu pláště časová složitost paměťová složitost
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 22. 5. 2017
Identifier: https://is.muni.cz/th/ef7a7/

Thesis defence

  • Date of defence: 22. 6. 2017
  • Supervisor: RNDr. Adam Jurčík, Ph.D.
  • Reader: Mgr. Jan Čejka

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / field:
Informatics / Information Systems

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.