Studium chaperonových komplexů v nádorových buňkách

Bc. Dávid Dzurický

Master's thesis

The study on chaperone complexes in tumor cells

Abstract:

Creating and maintaining a correct conformation of many proteins in the cell during physiological and especially under stress conditions is provided by molecular chaperons. During the process of malignant transformation, the accumulation of mutant or unstable proteins that require stabilization by chaperones occurs. The main component of the chaperone system are the Hsp70 and the Hsp90 proteins whose activity greatly affect the interaction with helper proteins, co-chaperones. The aim of this diploma thesis is the study of interaction partners of Hsp70 and Hsp90 using functional proteomics. Chaperone complexes were isolated by affinity chromatography and subsequently identified by quantitative mass spectrometry (SWATH). The results show that using specific Hsp90 inhibitors and nucleotides, we were able to track dynamic changes in the interaction of Hsp90 and Hsp70 with their co-chaperones or client proteins.

Abstract:

Vytvoření a udržení správné konformace mnoha proteinů v buňce při fyziologických a obzvlášť při stresových podmínkách je zabezpečované molekulárními chaperony. Během procesu maligní transformace dochází k akumulaci mutovaných nebo nestabilních proteinů, které vyžadují stabilizaci pomocí chaperonů. Hlavní složkou chaperonového systému jsou proteiny Hsp70 a Hsp90, jejichž aktivitu do velké míry ovlivňuje interakce s pomocnými proteiny, ko-chaperony. Cílem této diplomové práce bylo studium interakčních partnerů Hsp70 a Hsp90 pomocí funkční proteomiky. Chaperonové komplexy byly izolovány afinitní chromatografií a následně identifikovány pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie (SWATH). Z výsledků vyplývá, že použitím specifických inhibitorů Hsp90 a nukleotidů jsme byli schopni sledovat dynamické změny Hsp90 a Hsp70 s jejich ko-chaperony nebo klientskými proteiny.

Kľúčové slová

Chaperonový komplex, Hsp70, Hsp90, ko-chaperony, SDS pull-down, hmotnostní spektrometrie (SWATH), Chaperone komplex, co-chaperones, mass spectrometry (SWATH)

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 6. 2017
• Vedúci: MUDr. Petr Müller, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry