Mutace genu FGF5 a jejich vztah k délce srsti u vybraných plemen psů využívaných pro asistenční aktivity

Michaela Špačková

Bachelor's thesis

Mutations of FGF5 gene and their relation to hair length in selected breeds of assistance dogs

Abstract:

V této bakalářské práci byla řešena mutace genu FGF5 a její vliv na délku srsti u vybraných plemen. První část práce, literární rešerše, je zaměřena na typy, délku a strukturu psí srsti a na geny, které tyto vlastnosti ovlivňují. Zejména na gen FGF5, jehož mutace je zodpovědná za dlouhosrstý fenotyp u mnoha druhů zvířat. V druhé, experimentální části práce byl tento gen zkoumán. Byly vybrány 2 mutace, které by mohly být zodpovědné za dlouhosrstý fenotyp. Substituční mutace FGF5:c.284G>T, která na 284 místě v nukleotidové sekvenci provádí výměnu guaninu za tymin a duplikace FGF5:c.145_150dupACCAGC, která duplikuje 6 nukleotidový úsek DNA. Obě tyto mutace se nacházejí v exonu 1 genu FGF5. Vybraná plemena pro experimentální část byla německý ovčák, labradorský retriever, zlatý retriever, border kolie, bearded kolie jakožto zástupci plemen využívaných pro asistenční aktivity a československý vlčák, vybraný jako kontrastní plemeno, nevhodné pro asistenční aktivity, u kterého se ale v poslední době ve větší míře objevují dlouhosrstí jedinci. Experiment byl proveden na DNA, získané z bukálních stěrů, získané od 30 zástupců plemene německý ovčák, 30 zástupců labradorských retrieverů, 30 zástupců zlatých retrieverů, 79 zástupců border kolií, 81 zástupců bearded kolií a 96 zástupců československých vlčáků. Využité metody pro detekcí mutací byly restrikční štěpení a detekce mutací na gelové a kapilární elektroforéza. Zjištěné výsledky ukazují, že mutace zodpovědná za dlouhosrstý fenotyp u psů je substituční mutace FGF5:c.284G>T. Druhá otestovaná teorie je, že žádný z jedinců s dlouhosrstým fenotypem nebyl nositelem duplikace FGF5:c.145_150dupACCAGC.

Abstract:

The issue in this bachelor thesis is mutation in gene FGF5 and its affect on the length of coat in model population of the breeds used in the assistance activities. First part of this work, theoretical part, focus on types, texture and length of dogs coat and on the genes, that affects these characteristic. Mostly on gene FGF5, whose mutation is responsible for the long coat phenotype in many animal species. Second, experimental, part of this work examine this gene. There are two possible mutations responsible for longhaired phenotype. Substitution mutation FGF5:c.284G>T, which changes guanine to thymine on 284. place in nucleotide sequences and duplication mutation FGF5:c.145_150dupACCAGC, that causes duplication of 6 bases. Both mutations ale located in the exon 1 of gene FGF5. Breeds chosen for experimental part of this work was German shepherd, Labrador retriever, Golden retriever, Border collie and Bearded collie as representatives for breeds, that are used in assistance activities. Czechoslovakian wolfdog was used as contrasting breed, not suitable for assistance activities and because there is increasing number of longhaired dogs. Molecular analysis, obtained from buccal mucous membrane cells, was applied on 30 deputies of German shepherd, 30 deputies of Labrador retriever, 30 deputies of Golden retriever, 79 deputies of Border collie, 81 deputies of Bearded collie and 96 deputies of Czechoslovakian wolfdog. Used methods of analysis were restriction fragment length polymorphism and gel and capillary electrophoresis. Result of genotyping was, that mutation responsible for longhaired phenotype is substitution mutation FGF5:c.284G>T. Second result was, that no one of longhaired specimen carries the duplication mutation FGF5:c.145_150dupACCAGC.

Keywords

Canis lupus familiaris, délka srsti, FGF5, fibroblastový růstový faktor 5, genotypizace, asistenční plemena

Keywords

Canis lupus familiaris, assistance breeds, hair length, FGF5, fibroblast growth factor 5, genotyping

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 27. 4. 2018

Thesis defence

• Supervisor: doc. Dr. Ing. Pavel Vejl

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Bachelor programme / field:
Animal Science / Animal-assisted Therapies and Activities