Charakterizace terapeutických bakteriofágů Pseudomonas aeruginosa

Bc. Mirka Macíčková

Diplomová práce

Characterization of Pseudomonas aeruginosa therapeutic bacteriophages

Anotace:

V této práci jsou charakterizovány dva bakteriofágy, specifické k Pseudomonas aeruginosa, které byly izolovány z preparátů IntestiBacteriophagum a PyoBacteriophagum. Aby bylo možné tyto pseudomonádové bakteriofágy bezpečně využívat k léčebným účelům, je třeba sekvenovat jejich genom a posoudit jejich vhodnost k tomuto účelu. Oba fágy patří do čeledi Myoviridae. Délka jejich genomů je 87691 bp a 66062 bp, a v rámci těchto genomů bylo identifikováno 162 a 90 ORF. Fágy jsou lytické, a vzhledem k absenci genů pro virulenční faktory jsou vhodné k využití pro fágovou terapii.

Abstract:

Two bacteriophages specific to Pseudomonas aeruginosa, isolated from IntestiBacteriophagum and Pyo Bacteriophagum are characterized in this thesis. To investigate if it is safe to use the two bacteriophages for medical purposes, their genomes were sequenced. The genome of INTESTI phage is 87691 bp long with 162 ORFs. The genome of PYO phage contains 90 ORFs and is 66062 bp long. Both genomes were analysed in silico for presence of genes encoding virulence factors typical for temperate phages. Both of the phages are lytic, they belong to the Myoviridae family, and the absence of genes for virulence factors makes them suitable for phage therapy.

Klíčová slova

Pseudomonas aeruginosa, bakteriofág, fágová terapie, genom, bacteriophage, phage therapy, genome

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 2. 2016
• Vedoucí: doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika