Proč je \kur{Gloeocapsa} fialová- identifikace gleocapsinu, UV-protektivního pigmentu sinic.

Anastasiia SHCHUNINA

Bakalářská práce

Anotace:

Gloeocapsin je pigment o neznámé chemické struktuře, který se vyskytuje ve slizových obalech některých terestrických sinic a vyznačuje se acidobazickou barevnou reakcí. V rámci této bakalářské práce byly izolovány kolonie potenciálních producentů UV-protektivního barviva gloeocapsinu z rodu Gloeocapsa, pocházející z přírodních vzorků epilitických nárostů sinic z lokalit PR Opolenec, PR Holubovské hadce a PR Bořinka v České republice. Taxonomická identita jednotlivých kolonií byla potvrzena pomocí mikroskopické analýzy a sekvenace genu pro 16S rRNA. Na závěr byly získány sekvence celého genomu tří vybraných druhů (Gloeocapsa novacekii, G. violascea a G. atrata) pomocí amplifikace genomu metodou multiple-displacement amplification z jednotlivých kolonií a jejich sekvenace na platformě Illumina. Získaná data budou v navazující práci využita k identifikaci genů pro biosyntézu gloeocapsinu.

Abstract:

Gloeocapsin is a pigment of unknown chemical structure that occurs in the mucilaginous sheaths of some terrestrial cyanobacteria and is characterized by an acid-base color reaction. As part of this bachelor's thesis, colonies of potential producers of the UV-protective pigment gloeocapsin from the genus Gloeocapsa were isolated, originating from natural samples of epilithic cyanobacterial growths from PR Opolenec, PR Holubovské hadce and PR Bořinka in the Czech Republic. The taxonomic identity of individual colonies was confirmed by microscopic analysis and sequencing of the 16S rRNA gene. Finally, the whole genome sequences of three selected species (Gloeocapsa novacekii, G. violascea and G. atrata) were obtained using genome amplification by the multiple-displacement amplification method from individual colonies and their sequencing on the Illumina platform. The obtained data will be used in subsequent work to identify genes for the biosynthesis of gloeocapsin.

Klíčová slova

sinice, Gloeocapsa, Gloeocapsa alpina, Gloeocapsa violascea, Gloeocapsa atrata, Gloeocapsa novacekii, gloeocapsin, UV-protektivní pigment, 16S rRNA, MDA, Illumina, Fylogenetická analýza, genom

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Jan Mareš, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Biologie