Použití MLST markerů pro identifikaci druhu a kmenů entomopatogenní houby Beauveria bassiana.

Bc. Nicole JÁNOVÁ

Diplomová práce

Anotace:

Entomopatogenní houby jsou velmi různorodou skupinou přirozených nepřátel členovců. V posledních letech bylo vyvinuto velké množství mykoinsekticidů, s cílem nahradit škodlivější chemické insekticidy. Beauveria bassiana je pravděpodobně nejčastěji používaným prostředkem biologické kontroly. Pro studium interakce s okolním prostředím jsou zapotřebí metody, které umožní identifikaci kmenů příslušného izolátu houby. Cílem této studie tak bylo ověřit vhodnost metody MLST pro identifikaci kmenů B. bassiana. Z 10 vybraných lokusů bylo 6 úspěšně analyzováno. Počet zjištěných sekvenčních typů (ST) ukazuje, že tento přístup je vhodný k identifikaci kmenů u B. bassiana a může být snadno použit v dalším výzkumu.

Abstract:

Entomopathogenic fungi are a very diverse group of natural enemies of arthropods. In recent decades, a large number of mycoinsecticides have been developed to replace the more harmful chemical insecticides. Beauveria bassiana is probably the most commonly used biological control agent. To study its ecology and interaction in the environment, methods are needed that allow strain-specific identification of the respective fungal isolate. The aim of this study was to test the suitability of the MLST method (based on the extension of phylogenetic multi-locus DNA barcoding of fungi) for the identification of B. bassiana strains. Of the 10 loci selected, 6 were successfully analyzed. The number of sequence types (ST) identified indicates that this approach is feasible and can be readily adopted in further research.

Klíčová slova

entomopatogenní houby, Beauveria bassiana, "DNA barcoding", MLST

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 8. 12. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: PaedDr. Martina Žurovcová, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Klinická biologie