Studium nízkoafinitních interakcí protein-sacharid

Mgr. Pavel Hřeben

Bachelor's thesis

Study of low-affinity protein/saccharide interaction

Anotácia:

Burkholderia cenocepacia je gram-negativní bakterie schopná pomocí lektinů vyvolat infekci, která může mít fatální následky u lidí s oslabenou imunitou. Lektiny jsou proteiny schopné reverzibilně a specificky vázat mono- a oligosacharidy. Tyto proteiny hrají důležitou roli při rozpoznávání a umožňují adhezi patogenu na hostitelskou buňku, čímž může vzniknout infekce. Vzhledem k tomu, že takové interakce jsou většinou nízkoafinitní, je jejich výzkum důležitým prvkem při poznávání patogenů a stává se tak potenciální nadějí pro imunodeficitní pacienty. Bakalářská práce je zaměřena na studium interakcí lektinu BC2L-A delečního mutanta s některými vysokoafinitními a nízkoafinitními ligandy. Výzkum je prováděn pomocí izotermální titrační kalorimetrie s využitím přímé a vytěsňovací metody měření.

Abstract:

Burkholderia cenocepacia is a gram-negative bacteria, which can cause serious infections in imunodeficienct humans. These infections are based on bacteria´s lectins. Lectins are proteins capable to reversibly interact with specific mono- and oligosaccharides. These proteins play a main role in recognition and allow adhesion of a patogen on a host cell. This is how infection rises. These interactions are usually characterised by low affinity, also, the research of lowaffinity interactions between proteins and saccharides is very important for learning about patogens and for medicine development. Bachelor thesis is focused on study of interactions between lectin BC2L-A deletion mutant and some high- and low-affinity ligands. Study of interactions is made via isothermal titration calorimetry. The direct method and the displacement method of measurement will be used.

Kľúčové slová

BC2L-A, lectins, isothermal titration calorimetry, direct method, displacement method

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2012
• Vedúci: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Josef Houser, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry