Hledání polymorfismů spojených s rozvojem schizofrenie pomocí DNA čipu

Bc. Jiří Plesník, Ph.D.

Master's thesis

Searching of polymorphisms related with schizophrenia development with DNA chip

Abstract:

Schizofrenie patří celosvětově k jednomu z nejvážnějších problémů naší společnosti. Tato psychická porucha je známa pro široké spektrum svých příznaků, kdy se projevy této nemoci mohou lišit případ od případu. Počátek schizofrenie je ovlivněn mnoha faktory, kterými jsou jak vlivy prostředí, tak genetické pozadí jedince. Jedná se tedy o nemoc multifaktoriální, kdy schizofrenii neovlivňuje pouze jeden gen, ale velké množství genů malého efektu. Cílem této diplomové práce bylo provedení asociační studie na mužském souboru schizofreniků a zdravých kontrol. Pomocí metod GoldenGate assay, SNaPshot a RLFP bylo analyzováno 105 polymorfismů v rozdílných kandidátních genech. Po statistickém vyhodnocení byla nalezena významná asociace polymorfismu rs3737967, který leží v exonu genu pro MTHFR. Minoritní alela A byla vyhodnocena jako riziková (OR = 2.86, p = 0,384). Tento výsledek je v souladu s dosavadními hypotézami zapojení MTHFR v patogenesi schizofrenie, které předpokládají vliv tohoto enzymu na glutamátergní neurotransmisi společně s negativním vlivem zvýšené koncentrace homocysteinu v důsledku změny funkčnosti MTHFR.

Abstract:

Schizophrenia is worldwide one of the most severe problem in our society. This psychical disorder is known for its broad symptom spectrum, when manifests of this disease can vary case to case. Onset of the schizophrenia is influenced by many factors including environmental factors as well as genetic background of individual. Thus schizophrenia is multifactorial disease not affected by only one gene, but by many genes of small effect. Aim of this diploma thesis was to perform an association study on male group of schizophrenics and healthy controls. By GoldenGate assay, SNaPshot and RLFP 105 polymorphisms in different candidate genes were analyzed. Statistical evaluation of results discovered significant association in the polymorphism rs3737967 located in exon region of MTHFR gene. Minor allele A was evaluated as a risk allele (OR = 2.86, p = 0,384). This result is consistent with current hypotheses of MTHFR involving in the pathogenesis of the schizophrenia assuming impact of this protein to glutamatergic neurotransmission together with increased concentration of homocystein as a result of MTHFR functionality changes.

Keywords

schizofrenie, asociační studie, SNP, kandidátní geny, MTHFR, GoldenGate, SNaPshot, RFLP, vazebná nerovnováha, schizophrenia, association study, candidate genes, linkage disequilibrium

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 4. 6. 2013
• Supervisor: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Analytical Biochemistry