Analýza polymorfních cross-species mikrosatelitů pro determinaci paternity u pelikána afrického (Pelecanus rufescens)

Barbora Dvořáková

Bakalářská práce

The analysis of polymorphic cross-species microsatellites for determination of paternity in Pink-backed Pelican (Pelecanus rufescens)

Anotace:

Ve své bakalářské práci jsem se zabývala hledáním polymorfních mikrosatelitových lokusů u pelikána afrického (Pelecanus rufescens), které by bylo možno použít pro determinaci paternity u tohoto druhu. Pomocí cross-species PCR amplifikace za využití 221 párů primerů, navržených pro amplifikaci polymorfních mikrosatelitových lokusů izolovaných z druhů ptáků z řádů brodiví (Ciconiiformes), dlouhokřídlí (Charadriiformes), plameňáci (Phoenicopteriformes), potáplice (Gaviiformes), tučňáci (Sphenisciformes), veslonozí (Pelecaniformes) a vrubozobí (Anseriformes), jsem nalezla 27 polymorfních mikrosatelitových lokusů s počtem alel pohybujícím se v rozmezí 2 až 5 alel na lokus. Průměrný počet alel na lokus byl 2,6. Nejúspěšnější byla amplifikace za využití primerů původně navržených pro polymorfní lokusy druhů z řádů veslonozí, plameňáci a brodiví

Abstract:

In this bachelor thesis I dealt with the search for polymorfic microsatellite loci of the Pink-baked Pelican (Pelecanus rufesces), which could be used for determination of paternity in this species. By cross-species amplification technique using primers designed for amplification of polymorfic microsatellite loci isolated from species belonging to Ciconiiformes, Charadriiformes, Phoenicopteriformes, Gaviiformes, Sphenisciformes, Pelecaniformes and Anseriformes, I found 27 polymorfic microsatellite loci. The number of alleles per locus ranged from 2 to 5 with an average of 2,6 alleles per locus. The most succesful was amplification using primers designed for amplification of polymorfic microsatellite loci of species from Pelecaniformes, Phoenicopteriformes and Ciconiiformes

Klíčová slova

mikrosatelity, cross-species PCR amplifikace, pelikán africký, veslonozí

Keywords

microsatellites, cross-species PCR amplification, Pink-baked Pelican, Pelecaniformes

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 3. 6. 2010
• Vedoucí: Petr Nádvorník
• Oponent: Miloslav Kitner

Univerzita Palackého

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie