Transkriptomická analýza bakterie Bacillus cereus

Bc. Petra Kubasová

Bachelor's thesis

Transcriptomic analysis of Bacillus cereus

Anotácia:

Bakalářská práce se věnuje transkriptomické analýze bakterie Bacillus cereus. Bakterie Bacillus cereus se řadí mezi patogenní mikroorganismy, které mohou způsobit alimentární onemocnění skrze kontaminaci různých druhů potravin. Dnes preferovanou metodou pro analýzu transkriptomu je sekvenování nové generace (tzv. RNA-seq), které je i široce využíváno ke studiu patogenních bakterií. Na datech poskytnutých Výzkumnou infrastrukturou RECETOX byla provedena transkriptomická analýza. Cílem bylo určit transkripční profil a vliv kultivačních médií na bakterii. Výsledky mohou být aplikovány jako dietní doporučení pro potlačení toxicity při případné otravě způsobené bakterií Bacillus cereus.

Abstract:

The bachelor thesis is devoted to transcriptomic analysis of Bacillus cereus. Bacillus cereus is one of the pathogenic microorganisms that can cause alimentary diseases through contamination of different types of food. Today, the preferred method for transcriptome analysis is by next-generation sequencing (called RNA-seq), which is also widely used to study pathogenic bacteria. Transcriptomic analysis was performed on data provided by the RECETOX Research Infrastructure. The aim was to determine the transcriptional profile and the effect of culture media on the bacterium. The results can be applied as dietary recommendations to counteract toxicity in possible poisoning caused by Bacillus cereus.

Kľúčové slová

Bacillus cereus, Illumina, RNA-seq, sekvenování, transkriptom, sequencing, transcriptome

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2023
• Vedúci: Ing. Vojtěch Bartoň
• Oponent: Ing. Markéta Nykrýnová

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Computational biology and biomedicine / Biomedical bioinformatics