SW prostředí pro automatizovanou analýzu retinálních lézí pro systémy Clarity RetCam 3 a PHOENIX Icon

Marie Chadrabová

Master's thesis

SW Environment for Automatic Analysis of Retinal Lesions for Systems Clarity RetCam 3 and PHOENIX Icon

Anotácia:

Retinopatie nedonošených je aktuálně jednou z nejčastějších příčin poruchy zraku u dětí. Jedním z možných projevů onemocnění jsou retinální léze neboli hemoragie. Cílem diplomové práce je testování algoritmu pro segmentaci hemoragií na klinických datech ze sítnicových kamer Clarity RetCam 3 a Icon PHOENIX a následně mezi nimi vyhodnotit segmentační efektivitu. Posledním bodem je algoritmus implementovat do softwarového prostředí, které analyzuje retinální léze. Pro segmentaci lézí algoritmus využívá poloautomatickou iterativní metodu aktivních kontur. Hodnocení efektivity segmentačního algoritmu bylo provedeno na základě kvantitativní míry diference vůči zlatým standardům. Na základě statistických analýz byly zjištěny významné rozdíly skóre segmentace, a to v přesnosti, senzitivitě a specificitě mezi sítnicovými kamerami. Největší rozdíl v efektivitě byl zaznamenán v senzitivitě algoritmu, kde Clarity RetCam 3 dosáhl hodnoty 85,63 % oproti 81,79 % u Icon PHOENIX. Geometrická podobnost lézí a intenzitní spektrum ukázaly výhodu Clarity RetCam 3, přičemž největší rozdíl v efektivitě byl zjištěn v rozptylu hodnot, kde Clarity RetCam 3 dosáhl hodnoty 34,54 % oproti 51,75 % u Icon PHOENIX.

Abstract:

Retinopathy of prematurity is currently one of the most common causes of visual impairment in children. One of the possible manifestations of the disease is retinal lesions or hemorrhages. The aim of this thesis is to test an algorithm for segmenting hemorrhages on clinical data from Clarity RetCam 3 and Icon PHOENIX retinal cameras and then evaluate the segmentation efficiency between them. The final step is to implement the algorithm in a software environment that analyzes retinal lesions. The algorithm uses a semi-automatic iterative active contour method for lesion segmentation. Evaluation of the effectiveness of the segmentation algorithm was performed based on a quantitative measure of difference to gold standards. Based on statistical analyses, significant differences in segmentation scores were found in accuracy, sensitivity and specificity between retinal cameras. The largest difference in efficiency was observed in algorithm sensitivity, where Clarity RetCam 3 achieved a value of 85.63% compared to 81.79% for Icon PHOENIX. Geometric similarity of lesions and intensity spectrum showed an advantage for Clarity RetCam 3, with the largest difference in efficiency found in the variance of values, where Clarity RetCam 3 achieved a value of 34.54% compared to 51.75% for Icon PHOENIX.

Kľúčové slová

Retinopatie nedonošených (ROP), retinální léze, hemoragie, Clarity RetCam 3, Icon PHOENIX, metoda aktivních kontur

Keywords

Retinopathy of prematurity (ROP), retinal lesions, hemorrhages, Clarity RetCam 3, Icon PHOENIX, active contour method

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Jan Kubíček
• Oponent: Juraj Timkovič

VSB – Technical University of Ostrava

Fakulta elektrotechniky a informatiky

Master programme:
Biomedicínské inženýrství