Detekce mutací spojených s růstovými poruchami a makrozómií

Bc. Lucia CSERGEOVÁ

Diplomová práce

Detection of mutations associated with overgrowth syndromes and macrosomia

Anotace:

Diagnostika syndrómov nadmerného rastu je založená na klinických príznakoch pacienta a odlišnostiach medzi jednotlivými syndrómami. Neúplný fenotypový prejav a výskyt neobvyklých príznakov u pacienta vedie k čiastočnej diagnostike spektra chorôb a nemožnosti určiť vplyv ochorenia na budúci zdravotný stav pacienta, jeho predispozície a následný manažment liečby. Tieto skutočnosti kladú potrebu genetického testovania jedinca pre určenie genetických a epigenetických patologických zmien vedúcich k danému fenotypovému prejavu. V experimentálnej časti tejto práce sú popísané a hodnotené varianty detegované u pacientov prijatých v období 2015-2020. Následne boli vzorky 11 pacientov prijatých v rokoch 2020-2021 analyzované cestou masívne paralelného sekvenovania, Sangerovho sekvenovania cieľových oblastí, prípadne multiplexnou amplifikáciou prób závislou od ligácie pre určenie zmeny metylačného vzoru či detekciu delécií a inzercií. U dvoch pacientov z obdobia rokov 2020-2021 bola diagnóza potvrdená na molekulárnej úrovni.

Abstract:

The diagnosis of overgrowth syndromes is based on the patient's clinical symptoms and the differences between the syndromes. Incomplete phenotypic manifestation and the occurrence of unusual symptoms in the patient leads to a partial diagnosis of the spectrum of diseases, and the inability to determine the impact of the disease on the patient's future health, predispositions and subsequent treatment management. From these facts arises the need of genetic testing of an individual to determine the genetic and epigenetic pathological changes leading to a given phenotypic expression. The experimental part of this work describes and evaluates the variants detected in patients admitted in the period 2015-2020. Samples from 11 patients admitted between 2020 and 2021 were subsequently analyzed by massively parallel sequencing, Sanger target sequencing, alternatively Multiplex-ligation dependent probe amplification to determine change in methylation pattern, deletions and insertions. In two patients from the period 2020-2021, the diagnosis was confirmed at the molecular level.

Klíčová slova

syndróm nadmerného rastu, makrozómia, makrocefália, MPS, varianta

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 2. 1. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Arpád Bóday

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie