Nové biokatalyzátory z extrémofilních bakterií

Mgr. Ivana Drienovská

Bakalářská práce

New biocatalysts from extremophilic bacteria

Anotace:

V posledných rokoch narastá záujem o štúdium mikroorganizmov prispôsobených životu v extrémnych podmienkach. Enzýmy pochádzajúce z takýchto organizmov vykazujú aktivitu v neštandartných podmienkach ako je vysoká alebo nízka teplota, vysoké a nízke pH, vysoký tlak alebo vysoká slanosť. Tieto vlastnosti činia biokatalyzátory izolované z extrémofilných mikroorganizmov zaujímavé z hľadiska ich využitia v biotechnologických procesoch. V rámci bakalárskej práce bude uskutočnená literárna rešerš mapujúca súčasný stav znalostí biochémie, biológie a využitia enzýmov získaných z extremofilných baktérií so zamerením na halofilné baktérie. Experimentálna časť bude venovaná klonovaniu, expresii a purifikácii vybranej halogénalkándehalogenázy pochádzajúcej z halofilnej baktérie Hahella chejuensis KCTC 2396. Vypurifikovaný enzým bude štruktúrne charakterizovaný metódou cirkulárneho dichroizmu. Jeho substrátová špecificita bude meraná s vybranou sadou halogénovaných alifatických uhľovodíkov. S ohľadom na pôvod baktérie bude taktiež študovná stabilita halogénalkándehalogenázy v prítomnosti vybraných solí.

Abstract:

In the recent years, interest in studies of microrganisms adapted to extreme conditions considerably increases. Enzymes derived from such organisms show activity in nonstandard conditions such as high or low temeprature, high or low pH, pressure or high salinity. These properties make the biocatalysts isolated from extremophilic microorganisms interesting in regard to their use in biotechnological processes. The theoretical part will map current state of the art of biochemistry, biology and use of the enzymes gained from extremophilic bacteria with special focus on halophilic bacteria. Experimental part will be dedicated to cloning, expression and purification of chosen haloalkane dehalogenase from halophilic bacteria Hahella chejuensis KCTC 2396. Purified enzyme will be structurally characterized by circular dichroism. The substrate specificity will be measured by a set of halogenated aliphatic hydrocarbons. With respect to the origin of the bacteria, stability of the haloalkane dehalogenase in presence of several salts will be studied.

Keywords

Extrémofily, halofily, haloenzým, halogénalkándehalogenáza, extremophiles, halophiles, haloenzyme, haloalkane dehalogenase

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie