Epidemiologické analýzy dat onkologických pacientů se zaměřením na modelování časových trendů (aplikace na diagnózu rakoviny prsu)

Bc. Lucie Neuvirtová

Diplomová práce

Anotace:

Epidemiologie hraje velkou úlohu v hledání příčin vzniku nádorových onemocnění. K popisu četností výskytu událostí (nové onemocnění, úmrtí) v populaci se v neinfekční epidemiologii používají ukazatele incidence a mortalita. Pro nalezení trendů vývoje incidence a mortality se v této práci snažíme nalézt vhodný matematický (stochastický) model. Modelovat incidenci a mortalitu lze pomocí časových řad nebo regresních metod (a jejich různých obměn). V práci jsou jednotlivé metody popsány a následně jsou v diskuzi zmíněny jejich výhody a nevýhody. Jako nejvhodnější se jeví Age-Period-Cohort model (APC), speciální typ zobecněných lineárních modelů, v němž jsou data modelována pro všechny věkové skupiny dohromady. Modely jsou zde konkrétně aplikovány na data diagnózy rakoviny prsu (C50) z Národního onkologického registru (dostupné informace o incidenci a mortalitě na území ČR jsou od roku 1977). Na základě odhadnutých parametrů APC modelu je následně vytvořena predikce mortality diagnźy C50 pro období 2002-2006.

Abstract:

Epidemiology plays an important role in process of searching for causes of cancer development. Indicators - incidence and mortality - are ordinarily used for description of frequency of event occurence (new disease, death) in population of non-infectious disease. The aim of this thesis is to find correct mathematical models to gain trends of incidence and mortality development . To model incidence and mortality is possible by usage of regression methods and by time series. These methods are described and the discussion is provided on their advantages and disadvantages in this thesis. The best method seems to be Age-Period-Cohort (APC) models a special type of generalized linear models. In case of APC models, the dataset is analyzed complexely, not separately according to age groups. The APC models are applied on data of diagnosis of breast cancer (C50) which were provided by The National Oncological Register of the Czech Republic (information about incidence and mortality in the Czech Republic is available since 1977). Finally, the prediction of mortality of breast cancer for period 2002-2006 was made based on estimated parameters of the APC model.

Klíčová slova

epidemiologie, nádorová onemocnění, incidence, mortalita, modelování, Age-Period-Cohort modely, predikce

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 5. 2006

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 15. 6. 2006
• Vedoucí: RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Matematická biologie