Jan MACHÁŇ

Bachelor's thesis

Mapování struktur současných chemických látek

Mapping of current chemical scaffolds
Abstract:
Pojem scaffold se stává prominentním nástrojem v analýze velkých chemických dat, zejména pak v oblasti medicinální chemie. V této práci je popsán princip scaffoldu, jeho možné definice a využití v současných vědeckých článcích. Následně je provedena analýza využívající definici takzvaného Bemis-Murcko scaffoldu. V analýze jsou posléze chemická data získaná z databáze ChEMBL přiřazena státům světa s …more
Abstract:
The concept of scaffolds is a very prominent tool in analysing big chemical datasets, notably popular in medicinal chemistry. The concept itself as well as some of its possible definitions and most recent papers using it is described in this thesis. This analysis uses Bemis-Murcko scaffold definition. Mapping of dataset originating from the ChEMBL database with help of PubMed is performed. Data is …more
 

Keywords

bioinformatika molekulová struktura scaffold geografie chemie Python workflow mapování
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 5. 2021

Thesis defence

  • Supervisor: doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

MACHÁŇ, Jan. Mapování struktur současných chemických látek. Olomouc, 2021. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakulta
https://stag.upol.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=276759 Reference to the local database file of the institution

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
  • No theses on a related topic available.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses doscu6 doscu6/2
20/5/2021
Folders
Files
thesis BP-Jan_Machan.pdf
MARKLOVÁ, E.
21/5/2021

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.