Aplikace metod virtuálního screeningu pro hledání vysokoafinitních ligandů – Bc. Jakub Hynšt
Bc. Jakub Hynšt
Diplomová práce
Aplikace metod virtuálního screeningu pro hledání vysokoafinitních ligandů
Application of Virtual Screening for High-affinity Ligand Search
Anotace:
Cílem práce byl návrh metod a postupů vhodných pro hledání inhibitorů lektinu bakterie Pseudomonas aeruginosa PA-IIL. K tomuto jsme využívali především metody virtuálního screeningu a kvantově chemických výpočtů pro určení vazebných energií komplexů mezi PA-IIL a ligandy ze strukturních databází. V prvé řadě jsme jako referenční systém zvolili komplex tohoto proteinu s jeho přirozeným ligandem α-L …víceAbstract:
The goal of this thesis was design of methods and approaches suitable for finding inhibitors of the PA-IIL lectin from bacteria Pseudomonas Aeruginosa. We are using mainly methods of virtual screening and quantum chemistry methods for estimating of binding energies of PA-IIL complexed with ligands from structural databases. Firstly, we used the complex between PA-IIL and its natural ligand which is …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/q8wsb/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 24. 6. 2015
- Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie
Práce na příbuzné téma
-
Study of Fluorinated Graphene Reactivity Using Quantum Chemistry Methods
Dagmar ZAORALOVÁ -
Theoretical study of bacteriochlorophyll aggregates using methods of quantum chemistry and molecular mechanics
Marc NINOU-CODINA -
Studies of Nucleic Acids Using Quantum Chemical Methods and Computer Simulations
Arnošt Mládek -
Počítačové modelování nukleových kyselin metodami kvantové chemie a silových polí
Klaudia Mráziková -
Studium mechanismu bromoborace metodami kvantové chemie
Jakub Stošek -
Kvantově chemické studium mechanismu Z/E izomerizace dibrom(2-bromvinyl)boranu v rámci bromoborace acetylenu
Hugo Semrád -
Studium systémů mnoha elektronů metodou konfigurační interakce
Jakub Wagner -
Virtual screening of organic ligands
Wim Dehaen