Vyšetřování hemokultur z interních oddělení Nemocnice Tábor, a.s.

Mgr. Kamila SMRŽOVÁ

Bachelor's thesis

Diagnostics of the blood cultures from the departments of internal medicine in Nemocnice Tábor, a.s.

Abstract:

Předkládaná práce se zabývá vyšetřováním hemokultur z interních oddělení Nemocnice Tábor, a.s. V teoretické části jsou představeny nejdůležitější pojmy vztahující se k tématu infekcí krevního řečiště a sepse. Pozornost je také zaměřena na důležitý projekt v rámci Evropy EARS-Net. V praktické části je popsán postup laboratorního vyšetření hemokultur ve všech jeho fázích (preanalytická, analytická, postanalytická) včetně postupu prací v případě pozitivity vzorku. Dále práce hodnotí data o hemokulturách odebraných na interních odděleních Nemocnice Tábor, a.s. za rok 2018, přičemž stanovuje incidenci gramnegativních bakterií u pozitivních vzorků a snaží se postihnout rozdíly mezi skupinami komunitních a hospitalizovaných pacientů. Posledním bodem je pak poskytnutí přehledu o rezistenci k antibiotikům u nejčastěji zachycených gramnegativních tyčinek včetně srovnání s daty z EARS-Net (průměr za interní oddělení v Česku). Za rok 2018 bylo vyhodnoceno jako pozitivní celkem 527 hemokultivačních lahviček. Po odstranění duplicit a kontaminací bylo k další analýze použito celkem 267 pozitivních lahviček, ze kterých bylo vykultivováno celkem 97 kmenů gramnegativních tyčinek. Mezi nejčastěji zachycené gramnegativními bakteriálními druhy v pozitivních vzorcích patřily Escherichia coli (48,5 %) a Klebsiella pneumoniae (22,7 %). Rozdíly mezi skupinami komunitních a hospitalizovaných pacientů byly zachyceny pouze u kmene Klebsiella pneumoniae, výrazněji se však spektrum patogenů nelišilo. Při zhodnocení míry rezistence dvou nejčastěji zastoupených bakteriálních druhů je i ve srovnání s daty s EARS-Net (průměr za interní oddělení v Česku) znepokojující vyšší frekvence výskytu kmenů druhu Klebsiella pneumoniae rezistentních k cefalosporinům třetí generace a ciprofloxacinu.

Abstract:

The thesis describes blood culture testing at internal medicine departments of Nemocnice Tábor, a.s. (Tábor Hospital). The theoretical part presents the most important terms related to infections of the bloodstream and sepsis. EARS-Net, an important European project is also mentioned. The practical part describes blood culture laboratory process in all phases (preanalytical, analytical and post-analytical) including the steps taken when a sample is positive. Furthermore, the study evaluates data on blood cultures done at internal medicine departments of Nemocnice Tábor, a.s. in 2018, determining the incidence of gram-negative bacteria in positive samples and seeking to describe the differences between community and hospitalised patient groups. Finally, the study also gives an overview of antibiotic resistance in the most commonly detected gram-negative rods including a comparison to EARS-Net data (mean value for internal medicine departments in the Czech Republic). In total, 527 blood culture vials were tested as positive in 2018. A total of 267 positive vials were analysed further after the removal of duplicities and contaminations; a total of 97 strains of gram-negative rods were cultured from the vials. The most commonly detected gram-negative bacterial strains found in positive samples included Escherichia coli (48.5%) and Klebsiella pneumoniae (22.7%). Differences between community and hospitalised patient groups were found only for Klebsiella pneumoniae; however, the pathogens spectra in both groups were not distinctively different. In terms of resistance assessment in the two most common bacterial strains, a higher frequency of incidence of Klebsiella pneumoniae strains resistant to third generation cephalosporins and ciprofloxacin is alarming, also in comparison to EARS-Net data (mean value for internal medicine departments in the Czech Republic).

Keywords

sepse, hemokultura, kultivace, gramnegativní tyčinka, EARS-Net, antibiotika, rezistence

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2019

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Alice Kuchařová

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Zdravotní laborant