Fylogenetické vztahy rybomorek (Myxosporea) parazitujících u ryb z brakických vod

Jolana DAŇHELOVÁ

Bachelor's thesis

Phylogenetic relations of Myxosporea parasitizing in brackish water fish

Anotácia:

Práce se zabývá fylogenetickými vztahy myxosporeí parazitujících u ryb z brakických vod, ve kterých se mísí sladkovodní a mořská voda. V tomto prostředí dochází také k setkání mořské a sladkovodní parazitofauny myxosporeí. Myxosporea vytváří dvě hlavní fylogenetické linie právě v závislosti na prostředí svých rybích hostitelů. Cílem práce je zjistit, jaká Myxosporea parazitují u ryb žijících v brakických vodách, jejich příbuzenské vztahy a ve kterých fylogenetických liniích se nachází. Úvodní část práce je věnována taxonomii myxozoí, popisu jejich morfologie, životních cyklů a fylogeneze. V této práci jsem se především zaměřila na Myxosporea tři rybích hostitelů Scathophagus argus, Tetraodon nigroviridis a Tetraodon biocellatus, které jsou importovány do České republiky jako akvarijní ryby. DNA jsem izolovala pomocí fenolchloroformové metody. Fylogenetický marker SSU rDNA jsem amplifikovala pomocí metody PCR a získané produkty byly vyzualizovány pomocí gelové elektroforézy. Všechny tyto metody byly prováděny v Biologickém centru AV ČR, v. v. i. Parazitologickém ústavu, v laboratoři rybí protistologie v Českých Budějovicích. Získané vzorky byly sekvenovány v servisní laboratoři SEQme. Fylogenetické stromy byly konstruovány v programu Geneious, metodami maximum likelihood, maximum parsimony a Bayesovskou metodou. Získala jsem celkem SSU rDNA sekvence 10 druhů myxosporeí, které jsem fylogenetickou analýzou zařadila do fylogenetického stromu myxosporeí. Zjistila jsem, že brakické ryby jsou parazitovány jak druhy z mořské linie tak i ze sladkovodní linie myxosporeí a potvrdila jsem tak přítomnost těchto evolučně dávno oddělených větví parazitů u jednoho hostitele.

Abstract:

The bachelor thesis is focused on the phylogenetic relationships of Myxosporea which parasitizes fish from brackish water where freshwater is mixed with saltwater. In this environment, myxozoan parasites from the freswater fish hosts meet the ones from the marine fish. Myxosporea creates two main phylogenetic lineages depending directly on the environment of fish´s hosts. The aim of this thesis is to find out the following: which Myxosporea parasitizes fish living in brackish water, their relationships and to which phylogenetic lineage these myxosporeans belong. The introductory part of the thesis is dedicated to taxonomy of Myxozoa, description of their morphology, lifecycles and phylogenetics. I focused mainly on the Myxosporea from three brackish fish hosts Scathophagus argus, Tetraodon nigroviridis and Tetraodon biocellatus which are imported as aquarium fish to the Czech Republic. DNA of parasites was isolated by fenolchloroform method. A phylogenetic marker SSU rDNA was amplified by PCR method and gained products were visualized using gel electrophoresis. All these methods were carried out at the Biological Center of Science Academy of the Czech Republic, Institute of Parasitology, in the Laboratory of fish protistology in České Budějovice. PCR products were sequenced in a service laboratory SEQme. The phylogenetic trees were constructed in a program Geneious, by the following methods: maximum likelihood, maximum parsimony and the Bayesian inference method. I obtained SSU rDNA sequence of 10 species of Myxosporea which were placed by phylogenetic analysis into the phylogenetic tree of Myxosporea. I found out that brackish fish are parasitized by species of both marine and freshwater lineages of Myxosporea and I confirmed a presence of distantly related myxosporeans in one fish host.

Kľúčové slová

Myxozoa, Myxosporea, morfologie, hostitelé, fylogeneze

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: RNDr. Ivan Fiala, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Studies

Bachelor programme / odbor:
Specialization in Health Service / Health Technician