Přenos chemického signálu na úrovni Axinu: Přesměrování signálu prostřednictvím inhibitorů specifických protein-proteinových interakcí.

Mgr. Pavlína Víšková

Bachelor's thesis

Transduction of the chemical signal through Axin scafoldosome. Re-routing of signalling via interference with specific protein-protein interactions.

Abstract:

Scaffold proteiny slouží jako „lešení“ zprostředkovávající vazbu mnoha proteinových komponent různých signálních drah. Zablokováním vazby dané signální molekuly na scaffold protein je možné signální dráhy uměle regulovat – zapnout/vypnout, případně vynutit přepnutí do jiné signální kaskády. V této práci jsme se snažili prokázat možnost regulace signální dráhy Wnt na modelu interakce scaffold proteinu Axinu a Kasein kinázy 1ε (CK1ε). Pro tento účel byla připravena stabilní monoklonální buněčná linie HeLa T-REx s inducibilní expresí shRNA pro potlačení endogenního Axinu pomocí RNA interference (RNAi). V této buněčné linii byly exprimovány konstrukty Axinu s delecemi ve vazebných místech pro CK1ε a za snížených hladin endogenního Axinu byly pozorovány změny v aktivitě signální dráhy Wnt. Axin neschopný vázat CK1ε nedokázal plně nahradit funkci Axinu divokého typu („wild type“ Axinu).

Abstract:

Scaffold proteins serve as platforms for various protein components of different signaling pathways. By blocking the binding of a chosen signaling component on a scaffold protein, one can possibly regulate the signaling networks – turn them on/off and thereby change the direction of the signal flow. In this work we tried to show the possibility to regulate the Wnt signaling pathway by specific disruption of interaction between the scaffold protein Axin and Casein Kinase 1ε (CK1ε). For this purpose, a stable monoclonal cell line with an inducible RNA interference-mediated knock-down of endogenous Axin was generated. Axin constructs with deletions in the binding sites for CK1ε were expressed from plasmids in transiently transfected cells and under suppressed levels of endogenous Axin, changes in the activity of the Wnt signaling pathway were observed. Axin unable to bind CK1ε could not fully substitute the function of the wild type Axin.

Keywords

Axin, Kasein kináza 1ε, signální dráha Wnt, transkripční faktor c-Myc, RNA interference, scaffold protein, Casein Kinase 1ε, Wnt signaling pathway, c-Myc transcription factor

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2015

Thesis defence

• Date of defence: 18. 6. 2015
• Supervisor: doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry