Optimalizace krystalizačních podmínek pro přípravu monokrystalů systému komplexní sloučenina-protein.

Lukáš MASARYK

Bakalářská práce

Optimization of crystallization conditions for the preparation of single crystals of the system coordination compound-protein.

Anotace:

Metodiky kryštalizácie proteínov predstavujú neustále sa rozvíjajúcu oblasť, ktorá láka pozornosť viacerých prírodovedných odborov. Zisk kvalitných monokryštálov proteínu pre röntgenovú difrakčnú analýzu je empirickým procesom, ktorý musí byť optimalizovaný na konkrétny proteín. Táto práca sa zameriava na optimalizáciu kokryštalizácie vybraných biologicky aktívnych koordinačných zlúčenín s vybranými modelovými proteínmi s následným kvalitatívnym zhodnotením výsledkov experimentov, na základe mikroskopickej analýzy vylúčených kryštálov systému komplexná zlúčenina-modelový proteín. Pri realizácii práce bolo vykonaných viac ako 1400 kryštalizačných experimentov, ktoré umožnili upresniť podmienky kokryštalizácie vybraných štyroch koordinačných zlúčenín s modelovým proteínom lyzozýmom. Takto pripravené monokryštály interagujúcich systémov môžu v následnom difrakčnom experimente a vyriešením štruktúry týchto systémov poskytnúť nové cenné informácie o biologických aktivitách vybraných zlúčenín a naznačiť aj ich správanie a osud pri interakcii so zložitými biologickými systémami (napr. krvnou plazmou).

Abstract:

Methods of protein crystallization are a constantly evolving area that attracts the attention of several natural science disciplines. Obtaining of high-quality single crystals of the protein for X-ray diffraction analysis is an empirical process that has to be optimized for a particular protein. This work aims to optimize the co-crystallization of selected biologically active coordination compounds with selected model proteins, followed by a qualitative evaluation of the results of the experiments, based on the microscopic analysis of the crystals of the complex compound-model protein. In the course of the work, more than 1400 crystallization experiments were carried out, which made it possible to specify the conditions for the co-crystallization of selected four coordination compounds with the lysozyme used as a model protein. The single-crystals of the interacting systems thus prepared can provide new valuable information on the biological activities of the selected compounds in the subsequent diffraction experiment and resolve the structure of these systems and simultaneously indicate their behavior and fate when interacting with complex biological systems (such as blood plasma).

Klíčová slova

kryštalizácia proteínov, komplexná zlúčenina, monokryštál, optimalizácia, kryštalizačná kvapka, metóda visiacej kvapky

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. PharmDr. Ján Vančo, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Bioanorganická chemie