Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie s využitím technologie Orbitrap: Nové šance pro proteomiku

Mgr. Vendula Pernikářová

Bachelor's thesis

High-resolution mass spectrometry with Orbitrap technology: New chances for proteomics

Anotácia:

Bakalářská práce se zaměřuje na princip a proteomické aplikace vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie na bázi technologie Orbitrap. Jsou popsány základní konstrukční principy hybridních systémů využívajících analyzátor Orbitrap. Dále jsou vysvětleny principy hmotnostně-spektrometrických analýz peptidů a proteinů v těchto systémech v návaznosti na enzymatické štěpení proteinů a jejich separaci kapalinovou chromatografií. Důležitou částí je přehled nejdůležitějších proteomických aplikací technologie Orbitrap od identifikace a kvantifikace proteinů, přes uplatnění v „top-down“ proteomice až po analýzu posttranslačních modifikací. V experimentální části práce byl v návaznosti na předchozí studii identifikován pomocí LTQ Orbitrap Velos peptid korelující s významnými klinicko-patologickými parametry u karcinomu prsu.

Abstract:

The bachelor thesis is focused on the principle and proteomics applications of high-resolution mass spectrometry with Orbitrap technology. Basic principles of construction of hybrid systems using Orbitrap analyzer are described here. Principles of mass-spectrometric analysis of peptides and proteins in these systems following the enzymatic digestion of proteins and peptide separation by liquid chromatography are explained thereafter. Additional part of the thesis summarizes the most important proteomics applications of Orbitrap technology from protein identification and quantitation going through the „top-town“ proteomics approaches up to the analysis of posttranslation modifications. In the experimental part of the thesis the peptide related to important clinicopathological parameters of breast cancer was identified by LTQ Orbitrap Velos system in the consequence to previous studies.

Kľúčové slová

Orbitrap, proteomika, vysokorozličovací hmotnostní spektrometrie, karcinom prsu

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2011
• Vedúci: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry